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Programme Pluriformation

PPF Analyse des Systèmes Biologiques (ASB)

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Site Internet :
http://ppf.med.univ-tours.fr
Mél :
brigitte.arbeille@med.univ-tours.fr
Téléphone :
02 34 37 96 92
Télécopie :
02 47 47 82 07
Adresse :
10, Boulevard Tonnellé
37032 TOURS CEDEX 1
Rattachement(s) interne(s) :
UFR de Médecine
UFR de Sciences Pharmaceutiques
UFR de Sciences et Techniques


Organisation


Axe(s) / thème(s) de recherche

Le Programme Pluri-Formation "Analyse des Systèmes Biologiques" est une structure logistique transversale majeure de l'Université mise en place depuis 1995, qui regroupe la majeure partie voire la totalité des matériels lourds et des compétences correspondantes dans deux grands domaines d'analyse biologique, et à moindre degré d'analyse de matériaux, que sont l'Imagerie et l'Analyse Chimique.

Cette structure est découpée en trois départements correspondant aux spécificités technologiques et aux implantations par site de l'Université :
- le département des Microscopies ;
- le département Génomique ;
- le département d'Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale.

Les travaux scientifiques de ces différents départements représentent la synthèse des travaux des différentes équipes de recherche de l'Université François Rabelais et de l'INRA, pour certaines regroupées au sein de l'IFR 135 « Imagerie Fonctionnelle » et de l'IFR136 « Agents transmissibles et Infectiologie » mais au delà ils concernent également les projets scientifiques d'équipes d'Universités et de grands organismes extérieurs à TOURS ainsi que d'équipes d'Université ou de grands groupes industriels européens ou internationaux (cf. partenariats).

L'activité scientifique du PPF est représentée par les publications, les thèses de doctorat d'Université, les mémoires de masters ayant eu recours à la fois aux technologies et à l'encadrement spécifique de chacun des départements le composant.

Axe Science de la Vie et de la Santé

IFR 135 - Imagerie Fonctionnelle
IFR 136 - Agents Transmissibles et Infectiologie
E.A. 2106 - Biomolécules et Biotechnologies Végétales
E.A. 3852 - Laboratoire de Physiopathologie de la Paroi Artérielle (LABPART)
E.A. 3853 - Immuno-Pharmaco-Génétique des Anticorps thérapeutiques (IPGA)
E.A. 3854 - Bactéries et risque materno-foetal
E.A. 3857 - Synthèse et Physico-chimie Organique et Thérapeutique (SPOT)
E.A. Microenvironnement de l'hématopoïèse et cellules souches
FRE CNRS - Physiologie des Cellules Cardiaques et Vasculaires
INSERM ERI 19 - Virus, Pseudo-Virus : Morphogénèse et Antigénicité
INSERM U618 - Protéases et Vectorisation Pulmonaires
INSERM U646 - Ingéniérie de la vectorisation particulaire (Angers)
INSERM U921 - Nutrition, Croissance et Cancer (N2C)
INSERM U930 - Imagerie et Cerveau
UMR 483 - Immunologie Parasitaire, Vaccinologie et Biothérapie Anti-Infectieuse
UMR 6035 - Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte (IRBI)
UMR 6113 - Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - Equipe de Tours
UMR 6239 - Génétique, Immunothérapie, Chimie et Cancer
UMR 6542 - Physiologie des Cellules Cardiaques et Vasculaires
CHRU de Tours
INRA - Centre de Tours (Nouzilly)
Institut de génétique moléculaire de Montpellier

Axe Sciences et Technologies

E.A. 2098 - Chimie Physique des Interfaces et des Milieux Electrolytiques
E.A. 2640 - Laboratoire de Mécanique et Rhéologie
E.A. 3246 - Laboratoire de Microélectronique de Puissance (LMP)
FRE CNRS 2448 - Laboratoire Ultrasons, Signaux et Instrumentation (LUSSI)
UMR 6113 - Institut des Sciences de la Terre d'Orléans - Equipe de Tours
UMR 6157 - Laboratoire d'Electrodynamique des Matériaux Avancés (LEMA)
CEA de Monts

Compétences / savoir-faire / prestations offertes

Département des Microscopies :
Les prestations effectuées sur les équipements de la plate forme de recherche concernent aussi bien les cellules et tissu animaux et végétaux, les microorganismes, les particules isolées (macromolécules, ADN, liposomes...), les polymères et les matériaux.

Les méthodologies proposées sont :

l'analyse en MET et MEB de particules (virus, bactéries, ADN, liposomes, macromolécules) cellules et tissus la détection d'antigènes par immunomicroscopie électronique la localisation intracellulaire (protéines virales, facteurs de signalisation, transcytose...) par microscopie confocale l'état de surface et l'analyse élémentaire par MEB et sonde EDS de la structure de matériaux.

 

Département Génomique :
Génomique, recherche rapide de polymorphismes et de mutations, séquençage automatique d'ADN, traitement informatique des séquences, analyse du transcriptome par micro-puces, analyse quantitative de l'ADN et de l'ARN.


Département d'Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale :
Spectroscopie in vitro haute résolution multinoyaux Dosages biologiques, biochimiques Analyses quantitatives (fluides biologiques, extraits cellulaires) Etudes métaboliques et pharmacologiques Profil métabolique des fluides biologiques et analyse multivariée Recherche de marqueurs biologiques de dérégulation du métabolisme Mesure du Coefficient de diffusion apparent de fluides biologiques
- Contrôle de qualité
- Cosmétologie
- Pharmacologie Synthèse chimique Actions de formation Analyses physico-chimique macroscopiques et microscopiques de molécules organiques d'origine naturelle ou obtenues par synthèse :
- recherche, identification, structure
- études des propriétés physico-chimiques de médicaments, de  biomatériaux
- analyse qualitative et quantitative
- analyse de surface de biopolymères

    Partenariats

    Partenariats académiques internationaux

    Département des Microscopies :

    Département de Biochimie et de Microbiologie - Québec Laboratoire d'Anatomie Pathologique - Université de Liège - Belgique

      Partenariats académiques nationaux

      Département des Microscopies :

      INRA Nouzilly INSERM U553 - Hémostase, Endothélium et Angiogénèse - Paris INSERM U 370 - Virologie, Moléculaire et Cancer du Foie - Paris INSERM U689 - Centre de Recherche Cardiovasculaire - Paris INSERM U807 - Diagnostic des maladies génétiques par l'analyse de la signalisation calcique et des cellules fœtales circulantes - Paris UMR CNRS 6023 - Biologie des Protistes Parasitologie Moléculaire et Cellulaire - Clermont Ferrand URA CNRS 2172 - Groupe de Génétique des Biofilms - Institut Pasteur Paris EA 2148 - Bactériologie Virologie - Clermont-Ferrand USM 504 - Biologie Fonctionnelle des Protozoaires - MNHN, Paris Laboratoire de Neuropathologie - Hôpital Armand Trousseau - Paris

      Département Génomique :

      INRA Nouzilly CHRU de Tours

      Département d'Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale:

      CHRU de Tours INRA Nouzilly - Equipe Follicule, Ovocyte et Développement CEA le Ripault Monts Institut de Génétique Moléculaire - Montpellier INSERM U646 Ingénierie de la Vectorisation Particulaire - Angers

        Partenariats industriels

        Département des Microscopies :

        The R.W. Johnson Pharmaceutical Research Institute - San Diego Idm Biotech - Los Angeles Cell Genesys - San Francisco Texcell - Département Des Relations Industrielles - Institut Pasteur - Paris Aventis Pharma - Recherche, Développement - Vitry Sur Seine IUP (Imphy Ugine Precision) Nevers et GTT (Gaz Transport et Technigaz) Paris Idm - Immuno Designed Molecules - Paris Centre de Santé Sabouraud - Paris Vetoquinol - Lure Innothera - Chouze TI Automotive Systems - Nazelles Negron Spincontrol - Tours Pfizer - Amboise Vermon - Tours Onyxxia - Ballan Mire Double Helice - La Touche

        Département d'Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale :

        Spincontrol (Industrie cosmétologique) Laboratoires Brothier CEBIPHAR BMS Synarom Fabre Solvay-Pharma

          Équipements principaux

          Département des Microscopies :

          MET JEOL 1011 - 2007 MET JEOL 1230 - 2005 MEB ZEISS DSM 982 - 1996 Analyse EDS NORAN/SAMx - 1998 Microscope confocal à balayage laser OLYMPUS FV500 - 2002 Station de congélation EM.CPC LEICA 4 ultramicrotomes (dont 1 cryo.)

          Département Génomique :

          Thermocycleurs Séquenceur laser automatique d'ADN ABI 4 capillaires Appareil PCR quantitative BIORAD Séquenceur licor ADN Appareil PCR quantitative en temps réel Appareil DHPLC

          Département d'Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale :

          Spectromètre RMN haute résolution 500Mhz Bruker (2003) 3 sondes de mesure : une sonde large bande multi-noyaux (5mm), une sonde triple résonance : 1H, 19F, 13C (5mm), une sonde triple résonance 1mm (petit volume : 6 micro-L) Station de traitement de données CG-Masse, Helwett-Packard HP 5989A RMN, Avance DPX200 Bruker FT-Raman, RFS 100 Bruker

            Mots clés

            Microscopies, Génomique, Analyse Chimique et SRM Biologique et Médicale, PPF, PSTT
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