L'université François-Rabelais appuie son développement scientifique sur des pôles de formation et de recherche d'excellence, originaux et structurés qui permettent de couvrir l'ensemble de la chaîne de valeur, de la recherche fondamentale à l'application.

Pour que les formations de haut niveau dispensées par l'université, comme les connaissances produites dans les laboratoires bénéficient à la société en général et notamment à l'innovation et au développement économique, l'Etablissement s'est résolument ouvert sur les besoins de son environnement socioéconomique. Son engagement dans les partenariats et la valorisation est fondé sur la création de plateaux techniques mutualisés de haute technologie, voués à la recherche collaborative (les CER), sur la création de structures internes de transfert de connaissances et de technologies (les CETU) et sur une implication forte dans les pôles de compétitivité de la région Centre.