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A Tours, la valorisation de la recherche est conçue par l'université comme un outil de son développement scientifique, comme une force pour l'insertion professionnelle des jeunes diplômés et comme un levier du développement économique régional. Partagée par l'ensemble des acteurs socio-économiques, cette vision a conduit l'établissement à développer des pôles d'excellence originaux au sein desquels elle a construit des partenariats de recherche, non seulement avec les partenaires naturels (CNRS, Inserm, Inra, CEA, CHRU de Tours, ESCEM, etc.) mais aussi avec les entreprises locales et régionales.
L'Université de Tours est associée depuis 2004 à l'Université d'Orléans au sein du Pôle Universités Centre Val de Loire (PUCVL). Cette organisation permet de développer efficacement les opérations de transfert de technologie nécessaires à l'innovation et la compétitivité de la région Centre. Elle est partie prenante des trois pôles de compétitivité de la région Centre qui favorisent l'émergence de programmes de recherche partenariale. Elle est aussi impliquée dans le Cancéropôle du Grand Ouest et dans de nombreux autres réseaux.
En facilitant l'appropriation par la société des connaissances produites dans ses laboratoires, en aidant les entreprises à amplifier leur potentiel de R&D, en participant au renforcement de leurs ressources humaines, l'université François-Rabelais se place résolument parmi les acteurs majeurs de l'innovation et du développement économique régional.