Caroline Wybraniec

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caroline.wybraniec@univ-tours.fr

Parmi les espèces d’insectes autorisées pour la production de protéines animales en France et en Europe, la mouche soldat noire (Hermetia illucens ou black soldier fly abrégée en BSF) se distingue par un grand potentiel. En effet, malgré son régime à base de déchets organiques, la BSF n’est pas un vecteur connu de pathogènes humains. Les larves transforment ces déchets en ressources valorisables (engrais), tout en étant elles-mêmes converties en farines riches en protéines ou huiles pour l’alimentation animale.

Dans cette filière encore émergente, le manque de connaissances sur les pathogènes spécifiques à cette espèce et leurs modes de transmission représente un risque majeur pour sa viabilité économique.

Pour répondre à ce défi, le projet ANR FLYPATH rassemble des experts en écologie, virologie, microbiologie et modélisation mathématique, ainsi que trois acteurs industriels majeurs : Cycle Farms, Agronutris et Innovafeed. L’objectif est d’explorer les voies de contamination, les interactions entre les BSF et leurs pathogènes, et les mécanismes de transmission des maladies, afin de développer des outils de diagnostic et des stratégies de prévention adaptées.

Le projet s’articule autour de trois axes principaux :

1 - Écologie des pathogènes : Inventaire des sources de contamination et des réservoirs dans et autour des fermes.

2 - Réponse des BSF aux agents pathogènes : Étude de la pathogénicité, des mécanismes immunitaires et des effets sur la santé des insectes.

3 - Modélisation épidémiologique : Évaluation des risques et simulation de scénarios d’épidémies pour anticiper et prévenir les épidémies.

Le projet FLYPATH vise à produire la première évaluation qualitative et quantitative des risques sanitaires pour les producteurs. Les résultats permettront notamment d’élaborer :

Ce projet s’inscrit dans une démarche One Health, en lien avec les enjeux de sécurité alimentaire, santé animale et transition écologique. En combinant recherche fondamentale et applications industrielles, FLYPATH vise à contribuer à une agriculture plus résiliente et durable.
 

Among the insect species authorized for animal protein production in France and Europe, the black soldier fly (Hermetia illucens, or BSF) stands out for its great potential. Indeed, despite its diet based on organic waste, BSFs are not known to be a vector of human pathogens. The larvae transform this waste into valuable resources (fertilizers), while the insects themselves are converted into protein meals or oils for animal feed.

In this still-emerging sector, the lack of knowledge about BSF-specific pathogens and their transmission modes poses a major risk to its economic viability.

To address this challenge, the ANR FLYPATH project brings together experts in ecology, virology, microbiology, and mathematical modeling, as well as three major industrial players: Cycle Farms, Agronutris, and Innovafeed. The goal is to explore contamination pathways, interactions between BSF and their pathogens, and disease transmission mechanisms to develop diagnostic tools and tailored prevention strategies.

The project is structured around three main axes:

The FLYPATH project aims to produce the first qualitative and quantitative evaluation of health risks for producers. The results will notably enable the development of

This project aligns with the One Health approach, addressing food security, animal health, and ecological transition challenges. By combining fundamental research with industrial applications, FLYPATH aims to contribute to a more resilient and sustainable agriculture.

EN

EDUCATION

PhD in Microbial Ecology, Claude Bernard University Lyon 1, France, 2021 – 2024
Thesis Title: Occurrence of bacterial sanitary indicators associated with digestate spreading practices in agricultural soils
Supervisors: Dr Wessam Galia, Dr Benoit Cournoyer, Dr Geneviève Gagne

Master’s Degree in Microbiology, University of Lorraine, Nancy, France, 2019 – 2021
Specialisation (M2): Research and Innovation in Microbiology
Graduated with honours

Bachelor’s Degree in Cellular Biology and Physiology, University of Strasbourg, Strasbourg, France, 2018 – 2019

Technical Degree in bio-analysis and controls, École Technique Supérieure du Laboratoire, Paris, France, 2016 – 2018

PROFESSIONAL EXPERIENCE

Postdoctoral Researcher, May 2025 – Present
Institute for Research on Insect Biology, UMR 7261 CNRS, University of Tours, France
Supervisors: Dr Elisabeth Herniou, Pr Stéphane Boyer
Project: Insect Pathogens and Outbreak Risks in Black Soldier Fly farms

Postdoctoral Researcher, Jan 2025 – Mar 2025
Laboratoire d'Écologie Microbienne (Microbial Ecology Lab), UMR 5557 CNRS, Marcy-l'Étoile, France
Supervisor: Dr Wessam Galia
Project: Characterisation of the impact of anaerobic digestion of emerging organic matter on the sanitary quality and microbial communities of digestates and agricultural soils

PhD Student, Nov 2021 – Nov 2024
Laboratoire d'Écologie Microbienne (Microbial Ecology Lab), UMR 5557 VetAgro Sup, University of Lyon 1, Marcy-l'Étoile, France
Supervisors: Dr Wessam Galia, Dr Benoit Cournoyer, Dr Geneviève Gagne
Project: Occurrence of bacterial health hazard indicators associated with digestate spreading practices in agricultural soils

Research Intern (M2), Jan 2021 – Jul 2021
Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement, UMR 7564 CNRS, Nancy, France
Supervisor: Dr Xavier Bellanger
Project: Study of the link between microbial communities and antibiotic resistance in the Orne River

Lab Technician, Jul 2020 – Aug 2020
Laboratoires Atoutbio, Nancy, France

Technical degree intern, Dec 2017 – Jan 2018
CLARINS, Cergy-Pontoise, France
Supervisor: Myriam Haboul

Research intern, Jun 2017 – Jul 2017
Laboratoire Infection, Antimicrobials, Modelling, Evolution, UMR 1137 INSERM, Paris, France
Supervisor: Dr Méril Massot, Pr Eric Denamur
Project: Comparison of different PCR typing methods for antibiotic-resistant Escherichia coli clones found in veal calves at slaughter