LICENCE Sciences, Technologies, Santé MENTION Sciences de la Vie PARCOURS Biologie-Santé
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Responsable de la Licence Sciences de la Vie : Sylvaine Renault
Parcours Biologie-Santé : N. Peineau et A Petit
Détails
Option à choisir en L3
Renseignements pratiques
- Structure(s) de rattachement
- Durée de la formation
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- 3 ans
- Formation continue
- Formation diplômante
- Lieu(x) de la formation
- Tours Accessible en formation initiale, formation continue, contrat d'apprentissage
Les études de sciences de la vie à Tours
Présentation
Le parcours international a pour objectif de donner aux étudiants de licence Sciences de la Vie une dimension internationale à leurs études. Il permet de familiariser les étudiants avec des enseignements en langue anglaise pendant leur année de L2, et de les accompagner vers un semestre ou une année de scolarité ou un stage long en laboratoire à l'étranger en L3.
Cette formation inclue les objectifs de connaissance et de compétence de la licence générale Science de la Vie. La formation débute en L2 et se fait par sélection sur dossier à l’issu d’une L1 Sciences de la Vie.
Spécificités
- Mobiliser les concepts fondamentaux et les technologies de biologie moléculaire, de biochimie, de biologie cellulaire, de génétique, de microbiologie, de physiologie, d’immunologie, de classification du vivant, de biologie du développement et d’évolution
- Mobiliser les concepts fondamentaux de l’Écologie et des écosystèmes pour situer les problématiques biologiques et physiologiques
- Identifier et mener en autonomie les différentes étapes d’une démarche expérimentale
- Identifier, choisir et appliquer une combinaison d’outils analytiques adaptés pour caractériser les organismes et leur fonctionnement aux différents niveaux d’analyse
- Interpréter des données expérimentales pour envisager leur modélisation
- Valider un modèle par comparaison de ses prévisions aux résultats expérimentaux et apprécier ses limites de validité
- Identifier les sources d’erreur pour calculer l’incertitude sur un résultat expérimental
- Manipuler les mécanismes fondamentaux à l’échelle microscopique, modéliser les phénomènes macroscopiques, relier un phénomène macroscopique aux processus microscopiques
- Identifier les réglementations spécifiques et mettre en oeuvre les principales mesures de prévention en matière d’hygiène et de sécurité.
- Maîtriser la communication scientifique en anglais
Lieux
Tours
Responsable(s) de la formation
Responsable de la Licence Sciences de la Vie : Sylvaine Renault
Parcours Biologie-Santé : N. Peineau et A Petit
Admission
Niveau(x) de recrutement
Public ciblé
- curiosité scientifique
- avoir le sens pratique
- vouloir appréhender la biologie à l'échelle cellulaire et moléculaire
- être régulier dans son travail
Candidature
Modalités de candidature
Licence 1 : Pré-inscription sur www.parcoursup.fr
Licence 2 ou Licence 3 : Sélection sur dossier à l’issu d’une L1 Sciences de la Vie.Candidature sur ecandidat via la procédure de validation des acquis
Modalités de candidature spécifiques
Formation continue et reprise d'études
Cette licence est également accessible dans le cadre de la formation continue, avec éventuellement des validations d'acquis.
Programme
Contenu de la formation
Programme de L2, semestre 3
Commun aux parcours : Biologie-Santé ; Biodiversité-Écologie-Évolution ; International
Programme L2, semestre 4
Commun aux parcours : Biologie-Santé ; Biodiversité-Écologie-Évolution
Licence 3, semestre 5, parcours Biologie-Santé
Licence 3, semestre 6, parcours Biologie-Santé
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Semestre 1 SL1SCV
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- EP1.1 Diversité du monde vivant CM (Cours Magistral)33 h
- EP1.1 Diversité du monde vivant TD (Travaux Dirigés)13 h
- EP1.1 Diversité du monde vivant TP (Travaux Pratiques)16 h
EP1.1 Diversité du monde vivant CM
Cours Magistral 33 h
En savoir plusEP1.1 Diversité du monde vivant TD
Travaux Dirigés 13 h
En savoir plusEP1.1 Diversité du monde vivant TP
Travaux Pratiques 16 h
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EP1.1 Diversité du monde vivant
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs : Présenter l’organisation du monde vivant et appréhender sa biodiversité
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Contenu:
Cours : L’objectif de ce module est d’appréhender la diversité du vivant (végétal, animal et microbien) en s’appuyant sur son histoire évolutive. Nous aborderons la systématique phylogénétique, en nous focalisant sur les caractères acquis par les différentes lignées au cours du temps et au gré de leurs adaptations aux différents milieux de vie.
TD : Les séances de travaux dirigés permettront de renforcer les connaissances sous une forme plus ludique, tels que des jeux de questions réponse, et au travers d’histoires concrètes.
TP : Les séances de travaux pratiques ont pour objectif de renforcer les connaissances acquises en cours et en TD en manipulant, en observant, en disséquant, en comparant certains organismes des différentes lignées abordées en cours et en utilisant la représentation sous forme de dessins de tout ou parties de ces organismes.
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- EP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie CM (Cours Magistral)13 h
- EP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie TD (Travaux Dirigés)14 h
- EP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie TP (Travaux Pratiques)5 h
EP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie CM
Cours Magistral 13 h
En savoir plusEP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plusEP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie TP
Travaux Pratiques 5 h
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- EP1.2.2 Démarche expérimentale et Méthodologie CM (Cours Magistral)12 h
- EP1.2.2 Démarche expérimentale et Méthodologie TD (Travaux Dirigés)20 h
EP1.2.2 Démarche expérimentale et Méthodologie CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP1.2.2 Démarche expérimentale et Méthodologie TD
Travaux Dirigés 20 h
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EP1.2.1 Biologie cellulaire et histologie
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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L’objectif principal est de permettre aux étudiants de consolider leurs connaissances en Biologie Cellulaire générale afin de développer leur capacité à comprendre les concepts clés. La biologie y est enseignée de manière intégrée, de la cellule aux tissus (chez les animaux et les végétaux), des procaryotes aux eucaryotes en utilisant un ensemble d’outils allant de l’imagerie, à la biochimie et à la biologie moléculaire. Le cytosquelette, les mouvements cellulaires ainsi que la signalisation seront abordés en L2.
Contenu:
Cours :
Biologie Cellulaire : Introduction à la biologie cellulaire, évolution de la cellule. Il sera décrit l’essentiel de la cellule procaryote, eucaryote animale ou végétale. L’ensemble des structures cellulaires et de leurs fonctions sera abordé sur un modèle type de cellule animale (la membrane plasmique, le système endomembranaire, le noyau, l’énergétique cellulaire). Il sera souligné les différences et similarités entre les procaryotes et les eucaryotes, entre cellules animales et végétales.
Histologie : Introduction à l’histologie : présentation des 4 grands types de tissus, leurs grandes fonctions et leur localisation dans le corps animal.
EP1.2.2 Démarche expérimentale et Méthodologie
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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L’objectif de cette EP est de sensibiliser les étudiants l’unité de la biologie même si elle est enseignée pour des raisons pratiques en différentes disciplines. C’est aussi de montrer qu’il faut aussi s’intéresser aux autres disciplines scientifiques ainsi que les mathématiques pour faire avancer la connaissance. Finalement qu’il n’y a pas une méthodologie en biologie mais des méthodologies qui sont fonctions de la discipline.
Contenu:
Cours: Pour sensibiliser les étudiants à la diversité des disciplines en biologie, c’est un enseignant spécialiste de la discipline qui donne le cours. Les parties sont en interactions au travers de techniques ou de méthodologie. Ce cours s’appuie sur une présentation historique de l’interaction entre les découvertes majeures, l’évolution de la méthodologie et des techniques. Cette présentation permet de mettre en évidence les interconnexions entre les divers champs de la biologie et leurs apports mutuels. Cet enseignement a également pour objectif de montrer comment le développement des connaissances biologiques est intrinsèquement dépendantes des développements techniques des autres disciplines scientifiques (mathématiques, physique et chimie).
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- EP1.3.1 Biophysique CM (Cours Magistral)10.5 h
- EP1.3.1 Biophysique TD (Travaux Dirigés)11.5 h
EP1.3.1 Biophysique CM
Cours Magistral 10.5 h
En savoir plusEP1.3.1 Biophysique TD
Travaux Dirigés 11.5 h
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- EP1.3.2 Structure chimique de la matière CM (Cours Magistral)13 h
- EP1.3.2 Structure chimique de la matière TD (Travaux Dirigés)11 h
- EP1.3.2 Structure chimique de la matière TP (Travaux Pratiques)8 h
EP1.3.2 Structure chimique de la matière CM
Cours Magistral 13 h
En savoir plusEP1.3.2 Structure chimique de la matière TD
Travaux Dirigés 11 h
En savoir plusEP1.3.2 Structure chimique de la matière TP
Travaux Pratiques 8 h
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EP1.3.1 Biophysique
Élément Constitutif 22 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs :
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L’objectif de ce cours est de permettre aux étudiants de comprendre la nécessité d’une approche par la physique pour comprendre un certain nombre de phénomènes naturels liés à l’hydrostatique, l’hydrodynamique, les échanges membranaires (diffusion et osmose).
Une attention particulière sera portée à la mise en place du raisonnement scientifique nécessaire à la compréhension de ces phénomènes (problème/données/outils/résolution).
EP1.3.2 Structure chimique de la matière
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs Maîtriser les bases de la structure et de la réactivité chimique de la matière : éléments d’atomistique et configurations électroniques, géométrie des molécules, systèmes physico-chimiques, thermodynamique chimique, chimie en solution, réactions acide-base, calculs de pH, oxydo-réduction. Maîtriser les bonnes pratiques de laboratoire. Savoir proposer un protocole et réaliser des dosages (pH-métrique, redox), savoir déterminer un potentiel d’électrode.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Structure et propriété des atomes, configuration électronique, classification périodique. Liaison chimique, structure de Lewis et géométrie des molécules (modèle VSEPR). Systèmes physico-chimiques (description et grandeurs), thermodynamique chimique (premier et second principe), évolution des systèmes, équilibre chimique. Chimie en solution : réactions et équilibres acido-basiques, calculs de pH, réactions et équilibres d’oxydo-réduction, potentiels électrochimiques.
TD : Exercices en lien avec le cours et les TP.
TP : Bonnes pratiques de laboratoire (règles de sécurité, utilisation du matériel, gestion des déchets). Préparation de solutions. Equilibres chimiques (complexation, précipitation). Dosages redox, pH-métrique, préparation et étude de solutions tampons, étude de piles électrochimiques, mesures de potentiel d’électrode.
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- EP1.4.1 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP1.4.2 Outils Mathématiques CM (Cours Magistral)6 h
- EP1.4.2 Outils Mathématiques TD (Travaux Dirigés)10 h
- EP1.4.2 Outils Mathématiques TP (Travaux Pratiques)2 h
EP1.4.2 Outils Mathématiques CM
Cours Magistral 6 h
En savoir plusEP1.4.2 Outils Mathématiques TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plusEP1.4.2 Outils Mathématiques TP
Travaux Pratiques 2 h
En savoir plus -
- EP1.4.3 Compétences numériques TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP1.4.3 Compétences numériques TP (Travaux Pratiques)4 h
EP1.4.3 Compétences numériques TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP1.4.3 Compétences numériques TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus - EP1.4.4 Outils Documentaire6 h
EP1.4.1 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP1.4.2 Outils Mathématiques
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Acquérir et consolider les bases de mathématiques nécessaires à la biologie
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Contenu :
Cours et TD :
1/ Calcul : fractions, puissances, simplification, re´solution des e´quations du second degre´, ine´galite´s, valeur absolue, racines n-ie`mes, fractions rationnelles.
2/ E´quations de droites : e´quation re´duite, pente, ordonne´e a` l’origine. Tableaux de proportionnalite´ (re`gle de trois).
3/ Fonctions :
(a) De´finition d’une fonction y=f(x), image, ante´ce´dent, maximum, minimum, sens de variation, lecture graphique, re´solution graphique d’e´quations du type f(x) = a, intersection d’une droite avec l’axe des abscisses.
(b) De´rivation des fonctions, tableau de variation.
4/ Matrices : de´finition, addition, multiplication matricielle en particulier par une matrice colonne.
TP : Introduction au logiciel R, calcul matriciel
EP1.4.3 Compétences numériques
Élément Constitutif 14 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
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L’objectif pédagogique est d’acquérir des connaissances de programmation utiles au biologiste et de mettre en forme des documents texte. Compétences acquises : concevoir des programmes de calcul dans le cadre du tableur. Mettre en forme de longs documents texte dans le cadre du traitement de texte.
Contenu:
TD-TP : Adressages, fonctions logiques, fonctions statistiques. Réalisation de graphiques.
Mise en forme de documents textes.
EP1.4.4 Outils Documentaire
6 h
Objectif
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Ce module a pour objectif de donner aux étudiants les clés nécessaires pour une recherche documentaire efficace, pertinente et de niveau universitaire.
Contenu
Les TD auront lieu en présentiel et en distanciel
Découverte des locaux, des services et de l’offre documentaire de la bibliothèque universitaire de Grandmont.
Cours en ligne sur le plagiat. Cours en ligne sur la recherche d’information sur internet.
Sur quitus de présence
Module 1.1 : Diversité du monde vivant 1
UE 62 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 1.2 : Biologie cellulaire, Histologie, Démarche
UE 64 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 1.3 : Biophysique, structure chimique de la matière
UE 54 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 1.4 : Compétences transversales
UE 54 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 2 SL1SCV
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- EP2.1.1 Biochimie Structurale CM (Cours Magistral)16 h
- EP2.1.1 Biochimie Structurale TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP2.1.1 Biochimie Structurale TP (Travaux Pratiques)8 h
EP2.1.1 Biochimie Structurale CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP2.1.1 Biochimie Structurale TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP2.1.1 Biochimie Structurale TP
Travaux Pratiques 8 h
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- EP2.1.2 Génétique Mendélienne et moléculaire 1 CM (Cours Magistral)18 h
- EP2.1.2 Génétique Mendélienne et moléculaire 1 TD (Travaux Dirigés)148 h
EP2.1.2 Génétique Mendélienne et moléculaire 1 CM
Cours Magistral 18 h
En savoir plusEP2.1.2 Génétique Mendélienne et moléculaire 1 TD
Travaux Dirigés 148 h
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EP2.1.1 Biochimie Structurale
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs Acquisition des connaissances de base en biochimie.
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Contenu:
Cours : Structure et propriété de l’eau - Solutions et tampons - Structure et propriétés des oses simples, des polysaccharides, des protéoglycannes et des glycoprotéines. - Structure et propriétés des acides aminés, peptides et protéines - Structure des lipides - Constituants des acides nucléiques - Structure des nucléotides - Double hélice des acides nucléiques, réplication de l’ADN.
TD : Au travers des TD, des exercices d’application du cours magistral seront abordés (acides nucléiques, oses, acides aminés et protéines).
TP : Analyse spectrale de protéines, dosage glucidique dans des boissons sucrées.
EP2.1.2 Génétique Mendélienne et moléculaire 1
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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Révision des notions de base en génétique. Mise en place d’un socle de connaissances solide pour comprendre le fonctionnement moléculaire de la cellule. Cette UE vient en complément de la biologie cellulaire et se poursuit en L2.
Contenu:
Cours : Etude de la structure de l’ADN et des gènes, suivi de l’étude de la transcription et de la traduction chez les procaryotes et les eucaryotes. Effets des mutations de l’ADN sur la protéine et sur le fonctionnement cellulaire. Analyse de la transmission des allèles sauvage et mutant au cours des générations avec déterminisme génétique et cartographie de 2 gènes.
TD : exercices d’application sur les notions vues en CM
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- EP2.2.1 Diversité du monde vivant CM (Cours Magistral)20 h
- EP2.2.1 Diversité du monde vivant TP (Travaux Pratiques)4 h
EP2.2.1 Diversité du monde vivant CM
Cours Magistral 20 h
En savoir plusEP2.2.1 Diversité du monde vivant TP
Travaux Pratiques 4 h
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- EP2.2.2a Ecologie CM (Cours Magistral)8 h
- EP2.2.2a Ecologie TD (Travaux Dirigés)6 h
- EP2.2.2a Ecologie TP (Travaux Pratiques)10 h
EP2.2.2a Ecologie CM
Cours Magistral 8 h
En savoir plusEP2.2.2a Ecologie TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plusEP2.2.2a Ecologie TP
Travaux Pratiques 10 h
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- EP2.2.2b Ethologie CM (Cours Magistral)8 h
- EP2.2.2b Ethologie TD (Travaux Dirigés)6 h
EP2.2.2b Ethologie CM
Cours Magistral 8 h
En savoir plusEP2.2.2b Ethologie TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plus
EP2.2.1 Diversité du monde vivant
Élément Constitutif 24 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
1. Comprendre la classification phylogénétique des grandes lignées de deutérostomiens et des champignons
2. Analyser la diversité des animaux deutérostomiens : systématique, évolution, distribution, écologie.
3. Obtenir l’information nécessaire en consultant la bibliographie et des ressources en ligne de façon critique.
Contenu:
Cours :
Le cours se déroule en deux volets : Zoologie et Botanique.
Les différents embranchements des groupes étudiés seront présentés. Une attention spéciale sera dédiée aux caractères dérivés propres, notamment anatomiques et physiologiques. Ces aspects permettent l’identification de chaque groupe biologique et leurs liens phylogénétiques. Des aspects évolutifs, écologiques et comportementales sont également présentés pour chaque groupe biologique étudié.
Une partie du cours concerne une présentation de la diversité du monde fongique avec un point plus particulier sur les ascomycètes et basidiomycètes.
EP2.2.2a Ecologie
Élément Constitutif 24 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Appréhender de manière globale les relations entre les organismes et entre les organismes et leur milieu.
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Contenu:
Cours : Les enseignements dispensés dans cette EP permettent une première approche des grands thèmes de l’écologie autour de la structure et du fonctionnement des écosystèmes. Nous parlerons d’écologie fonctionnelle, de la circulation de l’énergie et de la matière dans la biosphère, des grands cycles biogéochimiques ainsi que des grandes biocénoses et des relations trophiques qui relient les organismes entre eux.
TP : Au cours de ces séances, nous aurons une sortie au cours de laquelle nous réaliserons la cartographie de la végétation d’une parcelle de forêt, ainsi qu’un inventaire de la faune présente et, ce, dans le but de mieux comprendre les relations qui unissent les organismes entre eux dans ce milieu. Les étudiants réaliseront un rapport de TP sur l’écologie de la parcelle étudiée.
EP2.2.2b Ethologie
Élément Constitutif 14 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs:
En savoir plus
Découvrir les champs disciplinaires de l'éthologie et des neurosciences comportementales à travers l'étude des émotions et, en particulier d'une émotion fondamentale et universelle : la peur.
Découvrir quelques recherches expérimentales de neurobiologie de la peur et de l'anxiété chez l'animal et chez l'homme.
Contenu :
Cours
Chapitre 1 : Rôles adaptatifs des émotions
Chapitre 2 : La peur et l'anxiété
Chapitre 3 : Neurobiologie de la peur et de l'anxiété
TD : Mesure du comportement animal et Modélisation animale de pathologies – Les formes de conditionnement chez l’animal – Cognition chez les primates non humains
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- EP2.3.2a Biophysique CM (Cours Magistral)10.5 h
- EP2.3.2a Biophysique TD (Travaux Dirigés)11 h
- EP2.3.2a Biophysique TP (Travaux Pratiques)12.5 h
EP2.3.2a Biophysique CM
Cours Magistral 10.5 h
En savoir plusEP2.3.2a Biophysique TD
Travaux Dirigés 11 h
En savoir plusEP2.3.2a Biophysique TP
Travaux Pratiques 12.5 h
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- EP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère CM (Cours Magistral)12 h
- EP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère TP (Travaux Pratiques)10 h
EP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP2.3.2b Processus de surface & évolution de la biosphère TP
Travaux Pratiques 10 h
En savoir plus
EP2.3.2a Biophysique
Élément Constitutif 34 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
L’objectif de ce cours est de permettre aux étudiants de comprendre la nécessité d’une approche par la physique pour comprendre un certain nombre de phénomènes naturels liés à la propagation d’une onde mécanique, à la propagation d’une onde lumineuse et la propagation de charges électriques.
Une attention particulière sera portée à la mise en place du raisonnement scientifique nécessaire à la compréhension de ces phénomènes (problème/données/outils/résolution).
Pour ce faire, quatre thèmes seront abordés :
1. Compréhension et conception du schéma d’un circuit électrique basique. Étude du transport de courant électrique dans un circuit électrique comprenant différents dipôles (passifs/actifs comme un générateur parfait de tension, une pile et/ou des résistances). Méthode de mesure d’un courant et d’une tension électrique. Puissance électrique et bilan énergétique (loi d’Ohm et chargement d’une batterie électrique).
2. Étude de la propagation des ondes lumineuses ou mécaniques afin de comprendre : la propagation d’une onde, les propriétés d’une Onde Plane Progressive (OPP), les phénomènes de propagation d’une onde lumineuse (longueur d’onde, vitesse de propagation, changement de milieu, retard/avance dans l’espace et le temps), les phénomènes de superposition de deux ondes (onde stationnaire dans les instruments de musiques à cordes, fréquences propres), l’évaluation de phénomènes acoustiques (puissance, intensité sonore, niveau sonore, …).
3. Étude de l’optique linéaire afin de comprendre : la notion de stigmatisme, la détermination des images (position, taille, …) par calcul ou par construction géométrique, le fonctionnement de l’œil humain ainsi que la correction des principaux défauts de la vision (myopie, hypermétropie et presbytie) et de maîtriser la compréhension du fonctionnement d’un microscope optique et son utilisation.
EP2.3.2b Processus de surface et évolution de la biosphère
Élément Constitutif 34 h - 4 Crédits ECTS
En savoir plus -
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- EP2.3.1 Chimie organique CM (Cours Magistral)13.5 h
- EP2.3.1 Chimie organique TD (Travaux Dirigés)18 h
- EP2.3.1 Chimie organique TP (Travaux Pratiques)1.5 h
EP2.3.1 Chimie organique CM
Cours Magistral 13.5 h
En savoir plusEP2.3.1 Chimie organique TD
Travaux Dirigés 18 h
En savoir plusEP2.3.1 Chimie organique TP
Travaux Pratiques 1.5 h
En savoir plus
Choix EP2 M2.3 S2 SL1SCV
- 4 Crédits ECTS
En savoir plusEP2.3.1 Chimie organique
Élément Constitutif 33 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Acquérir les notions de bases en chimie organique, adaptées et nécessaires pour la compréhension des phénomènes biologiques, à la fois à l’échelle micro et macroscopique et utilisation de la chimie organique notamment pour la compréhension de la biologie moléculaire et de la biochimie.
Contenu:
Rappels : Hybridation du carbone et géométrie des molécules organiques, nomenclature des grandes fonctions chimiques et biochimiques, oxydo-réduction, écriture des molécules en formule topologique, et en représentation de Cram, Fischer et Newman, isomérie et stéréoisomérie, éléments de base des effets électroniques et leurs implications dans les structures des molécules du vivant.
Chapitre 1 Nomenclature :
Chapitre 2 Isomérie :
Chapitre 3 Effets électroniques et structures des protéines
Chapitre 4 Acides aminés Peptides et Protéines
Chapitre 5 Réactions chimiques
Chapitre 6 Réactions chimiques dans le monde du vivant -
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- EP2.4.1 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP2.4.2 Outils Mathématiques CM (Cours Magistral)4 h
- EP2.4.2 Outils Mathématiques TD (Travaux Dirigés)6 h
EP2.4.2 Outils Mathématiques CM
Cours Magistral 4 h
En savoir plusEP2.4.2 Outils Mathématiques TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plus -
- EP2.4.3 Informatique TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP2.4.3 Informatique TP (Travaux Pratiques)4 h
EP2.4.3 Informatique TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP2.4.3 Informatique TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus - EP2.4.4 Démarche expérimentale et méthodologie (Élément Constitutif)10 h - 1 Crédits ECTS
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- EP2.4.5 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP2.4.5 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP2.4.5 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP2.4.5 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
En savoir plus
EP2.4.1 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale
EP2.4.2 Outils Mathématiques
Élément Constitutif 10 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : d’acquérir et à consolider les bases de mathématiques nécessaires à la biologie
En savoir plus
Contenu:
Cours et TD :
1/ De´rive´es successives. E´tude de fonctions avec les points d’inflexion.
2/ Fonctions logarithmes (ne´pe´rien, logarithme en bases 2 et 10) et fonctions exponentielles (e´criture en puissances de 10) avec les e´quations fonctionnelles. Ordre de grandeur. Re´solution d’ine´quations du type q^n ? a.
3/ Suites arithme´tiques et ge´ome´triques
EP2.4.3 Informatique
Élément Constitutif 12 h - 1 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
L’objectif pédagogique est d’acquérir des connaissances de programmation utiles au biologiste. Compétences acquises : Concevoir des programmes de calcul dans le cadre du tableur.
Contenu:
TD-TP : Fonctions de texte, tris et filtres, fonctions de recherche, fonctions de dates et d’heures.
EP2.4.4 Démarche expérimentale et méthodologie
Élément Constitutif 10 h - 1 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Acquisition de la méthodologie d’analyse de résultats expérimentaux obtenus par certaines des techniques vues au premier semestre.
Contenu:
TD: 4 séances seront destinées à l’analyse de jeux de données. La première portera sur des problèmes de dilution de solution et de culture, de différence entre ce que l’on mesure et ce que l’on veut déterminer comme concentration, l’analyse dimensionnelle etc. La seconde portera sur l’analyse graphique de résultats expérimentaux (courbe de calibration ou courbe exponentielle de culture), l’utilisation d’échelles linéaire et semi-logarithmique. Dans ces 2 premières séances seront abordés les notions de données expérimentales, de comment exclure ou pas un point, comment faire une droite pour relier les points expérimentaux, la signification de l’intersection de cette droite avec les axes et le coefficient directeur. La séance 3 sera consacré à l’analyse de d’acide nucléique et de protéines sur gel avec détermination de poids moléculaire de protéines ou de fragments d’ADN. La séance 4 portera sur l’analyse d’images de microscopie où seront abordées les notions d’échelle, de marqueurs cellulaires, de contrôles et de représentativités. Ces 4 séances seront suivies d'un examen final endéans le qui suit la séance 4. La séance 5 qui aura lieu dans le mois qui suit l'examen sera consacrée à sa correction.
EP2.4.5 Mobil
4 h
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Module 2.1 : Biochimie-Génétique
UE 64 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 2.2 : Diversité du monde vivant 2, Ecologie Ethologie
UE 62 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 2.3 : Biophysique, Chimie ou Géosciences
UE - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 2.4 : Compétences transversales
UE 58 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 3 SL2SVN
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- EP3.1.1 Physiologie animale CM (Cours Magistral)24 h
- EP3.1.1 Physiologie animale TD (Travaux Dirigés)16 h
- EP3.1.1 Physiologie animale TP (Travaux Pratiques)4 h
EP3.1.1 Physiologie animale CM
Cours Magistral 24 h
En savoir plusEP3.1.1 Physiologie animale TD
Travaux Dirigés 16 h
En savoir plusEP3.1.1 Physiologie animale TP
Travaux Pratiques 4 h
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- EP3.1.2 Biologie cellulaire et signalisation CM (Cours Magistral)16 h
- EP3.1.2 Biologie cellulaire et signalisation TD (Travaux Dirigés)12 h
EP3.1.2 Biologie cellulaire et signalisation CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP3.1.2 Biologie cellulaire et signalisation TD
Travaux Dirigés 12 h
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EP3.1.1 Physiologie animale
Élément Constitutif 44 h - 5 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
L'objectif est d'apporter les connaissances de base théoriques et expérimentales de la neurophysiologie et de l'endocrinologie. Les exemples porteront sur les mammifères et notamment sur la physiologie humaine.
Contenu:
Cours : Neurophysiologie : Potentiel de membrane et potentiel d’action ; Synapses et jonction neuro-musculaire ; Physiologie musculaire.
Système endocrinien : Notion d'hormone et de récepteurs hormonaux, production, distribution, mode de sécrétion et d'action. Contrôle hormonal. Rôle des diverses glandes endocriniennes.
TD: Apprentissage de la méthodologie en physiologie. Analyse de données électrophysiologiques.
TP : Réalisation d’expériences en physiologie nerveuse via le logiciel Neurosim
EP3.1.2 Biologie cellulaire et signalisation
Élément Constitutif 28 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Cet enseignement permet d’approfondir l’enseignement reçu en L1. La compréhension et la maîtrise du cours seront essentielles pour aborder l’étude de mécanismes physiologiques plus complexes. L’objectif est de comprendre la place de la cellule animale dans son environnement et la manière dont elle peut réagir par les modifications de son cytosquelette. Ces notions seront abordées et intégrées dans l’enseignement en prenant comme exemple des processus plus complexes qui pourront être l’inflammation, la coagulation, la réparation tissulaire, les nanotechnologies, les métastases…. Les mécanismes moléculaires mis en jeu dans la perception et la transmission intracellulaire du signal seront appréhendés et illustrés au travers de réponses physiologiques de la cellule animale et végétale. Ce qui permettra aux étudiants d’aborder les bases fondamentales de la signalisation cellulaire.
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- EP3.2.1 Physiologie végétale CM (Cours Magistral)22.5 h
- EP3.2.1 Physiologie végétale TD (Travaux Dirigés)7.5 h
- EP3.2.1 Physiologie végétale TP (Travaux Pratiques)12 h
EP3.2.1 Physiologie végétale CM
Cours Magistral 22.5 h
En savoir plusEP3.2.1 Physiologie végétale TD
Travaux Dirigés 7.5 h
En savoir plusEP3.2.1 Physiologie végétale TP
Travaux Pratiques 12 h
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- EP3.2.2 Introduction au développement végétal CM (Cours Magistral)10 h
- EP3.2.2 Introduction au développement végétal TD (Travaux Dirigés)2 h
EP3.2.2 Introduction au développement végétal CM
Cours Magistral 10 h
En savoir plusEP3.2.2 Introduction au développement végétal TD
Travaux Dirigés 2 h
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- EP3.2.3 Introduction au développement animal CM (Cours Magistral)6 h
- EP3.2.3 Introduction au développement animal TD (Travaux Dirigés)6 h
EP3.2.3 Introduction au développement animal CM
Cours Magistral 6 h
En savoir plusEP3.2.3 Introduction au développement animal TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plus
EP3.2.1 Physiologie végétale
Élément Constitutif 42 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Connaître et comprendre comment les végétaux font l’acquisition 1) d’énergie lumineuse et la transforme en énergie chimique, de minéraux pour la synthèse des constituants organiques, 2) d’eau pour la croissance et le transport des sèves. Les compétences disciplinaires acquises sont les suivantes : Méthodologiques : Analyse des échanges gazeux dans la photosynthèse. Analyse des échanges d’eau dans le continuum sol-plante-atmosphère. - Analyse et interprétations de résultats expérimentaux. Techniques : Techniques d’étude expérimentale des fonctions photosynthétiques, des échanges plante-eau, de l’assimilation de nitrate
En savoir plus
Contenu:
Cours : Nutrition organique des végétaux : la photosynthèse, autotrophie carbonée, autotrophie azotée, autotrophie soufrée - Alimentation en eau et nutrition minérale des végétaux : Le sol, l’eau et la plante – Absorption et circulation de l’eau et des sels minéraux dans la plante –
TD : Application des connaissances acquises sur la photosynthèse, l’autotrophie carbonée, l’alimentation en eau et la nutrition minérale des végétaux pour la résolution d’exercices pratiques. Exemples d’application de ces connaissances à l’étude des fonctions de végétaux d’intérêt.
TP : Mise en évidence des pigments photosynthétiques - Analyse des échanges plante-eau. Fonctions de la nitrate réductase.
EP3.2.2 Introduction au développement végétal
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Connaître et comprendre comment la croissance cellulaire, les régulateurs de morphogenèse, les facteurs de l’environnement participent au développement des végétaux.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Biologie du développement et de la morphogenèse : Rôles des facteurs de l’environnement (tropismes, tactismes, nutrition) et des régulateurs de morphogenèse dans le développement végétal –
TD : Application des connaissances acquises à l’étude du développement et de la morphogénèse des végétaux d’intérêt.
EP3.2.3 Introduction au développement animal
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectif : Acquisition des notions de base de la biologie du développement animal.
En savoir plus
Contenu :
Cours : Description des grandes étapes de l’embryogenèse chez le modèle amphibien, ainsi que des mécanismes fondamentaux de contrôle du développement embryonnaire (induction, régulations…).
TD : Remobilisation des concepts vus en cours. Analyse de documents scientifiques simples permettant de faire le lien entre les notions de biologie du développement et les thématiques de santé et d’évolution.
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- EP3.3.2a Microbiologie générale CM (Cours Magistral)20 h
- EP3.3.2a Microbiologie générale TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP3.3.2a Microbiologie générale TP (Travaux Pratiques)6 h
EP3.3.2a Microbiologie générale CM
Cours Magistral 20 h
En savoir plusEP3.3.2a Microbiologie générale TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP3.3.2a Microbiologie générale TP
Travaux Pratiques 6 h
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- EP3.2.2 Risques naturels 1 CM (Cours Magistral)9 h
- EP3.2.2 Risques naturels 1 TD (Travaux Dirigés)6 h
EP3.2.2 Risques naturels 1 CM
Cours Magistral 9 h
En savoir plusEP3.2.2 Risques naturels 1 TD
Travaux Dirigés 6 h
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- EP3.2.1 Sols : interface fragile CM (Cours Magistral)10 h
- EP3.2.1 Sols : interface fragile TD (Travaux Dirigés)4 h
EP3.2.1 Sols : interface fragile CM
Cours Magistral 10 h
En savoir plusEP3.2.1 Sols : interface fragile TD
Travaux Dirigés 4 h
En savoir plus
EP3.2.2 Risques naturels 1
Élément Constitutif 15 h - 2 Crédits ECTS
En savoir plusEP3.3.2b1 Géosciences : Sols : Interface fragile
Élément Constitutif 14 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Acquérir des connaissances de base sur les sols, qui constituent un compartiment clé de l’écosystème à l’interface entre l’atmosphère, l’hydrosphère, la lithosphère et la biosphère.
En savoir plus
Compétences visées:
- Connaissances de base sur les sols et leur interaction avec l’écosystème.
- Compréhension des liens entre constituants et propriétés des sols.
- Savoir positionner, réaliser et décrire des sondages de sol sur le terrain et interpréter leur formation, leurs propriétés et leurs atouts et limites du point de vue de la production agricole et des risques environnementaux.
- Capacité à interpréter des analyses physico-chimiques de sols.
- Capacité à lire et interpréter une carte de sols
Contenu synthétique:
CM
- Importance des sols dans l’écosystème
- Problématiques environnementales
- Principaux constituants minéraux et organiques
- Modalités de formation et propriétés physico-chimiques.
TD et TP en salle : Familiarisation avec les analyses physico-chimiques des sols et lecture de cartes de sols.
TP sur le terrain : Une demi-journée permet d’observer les sols in-situ, de les décrire et de les resituer dans leur environnement.
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EP3.3.2a Microbiologie générale
Élément Constitutif 34 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : S’initier à la Bactériologie et à la Virologie.
En savoir plus
Contenu:
Connaissance de la structure d’une bactérie et des principaux groupes de virus, des bases de leur classification et de leurs modes de multiplication. Compréhension de leurs interactions avec le monde vivant, de leurs rôles dans des infections, des moyens de les étudier, de les conserver et de les éliminer. Capacité à travailler stérilement et à cultiver des bactéries en milieu liquide et en milieu gélosé. Aptitude à reconnaître et à différencier les bactéries par divers examens microscopiques et l’observation macroscopique des cultures.
Cours :
CM Bactériologie : Rappel de la diversité des unicellulaires en référence au cours de L1 Diversité du vivant - Structure de la cellule procaryote : éléments constants et inconstants - Principes d’identification et de classification des bactéries - Nutrition et croissance bactérienne ; milieux de culture - Notions de virulence et de pathogénicité - Moyens de conservation et d’élimination.
CM Virologie : Définition d'un virus, structures, cycles de réplication et classification. Réponse de l'hôte face à l'infection. Techniques de base en virologie.
CM Parasitologie : Présentation de parasites et de leurs cycles.
TD : Applications du cours sous forme d’exercices.
TP : Transvasement stérile, ensemencement, état frais et Gram, observation.
EP3.3.2b Géosciences
Élément Constitutif - 4 Crédits ECTS
En savoir plus -
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- EP3.3.1 Génétique mendélienne et moléculaire 2 CM (Cours Magistral)18 h
- EP3.3.1 Génétique mendélienne et moléculaire 2 TD (Travaux Dirigés)16 h
EP3.3.1 Génétique mendélienne et moléculaire 2 CM
Cours Magistral 18 h
En savoir plusEP3.3.1 Génétique mendélienne et moléculaire 2 TD
Travaux Dirigés 16 h
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Choix EP2 M3.3 S3 SL2SCV
- 4 Crédits ECTS
En savoir plusEP3.3.1 Génétique mendélienne et moléculaire 2
Élément Constitutif 34 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Consolidation et approfondissement des notions développées en L1. L’étudiant acquerra la compréhension fine des mécanismes moléculaires liés à la molécule ADN.
Contenu:
Cours : Compréhension des mécanismes de régulations des grandes voies vues en L1 :
Régulation de la transcription, de la traduction, et du cycle cellulaire. Étude des mécanismes de réparation des lésions de l’ADN. Etude des régulations géniques par les petits ARNs. Cartographie des gènes chez les procaryotes.
TD : exercices d’application sur les notions vues en CM
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- EP3.4.1 Anglais (Élément Constitutif)28 h - 2 Crédits ECTS
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- EP3.4.2 Sensibilisation aux formations professionelles CM (Cours Magistral)12 h
- EP3.4.2 Sensibilisation aux formations professionelles TD (Travaux Dirigés)2 h
EP3.4.2 Sensibilisation aux formations professionelles CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP3.4.2 Sensibilisation aux formations professionelles TD
Travaux Dirigés 2 h
En savoir plus - EP3.4.3 Transition écologique et sociétale (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP3.4.4 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP3.4.4 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP3.4.4 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP3.4.4 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
En savoir plus
EP3.4.1 Anglais
Élément Constitutif 28 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP3.4.2 Sensibilisation aux formations professionelles
Élément Constitutif 14 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Préparation du projet professionnel post 2eme année - Sensibilisation les étudiants de 2eme année aux formations professionnelles par la présentation de différentes problématiques et leur intégration dans une formation professionnelle.
Contenu:
Cours et TD : Présentation des finalités des formations professionnelles et des compétences requises.
EP3.4.3 Transition écologique et sociétale
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
En savoir plusEP3.4.4 Mobil
4 h
En savoir plus
Module 3.1 : Physiologie animale & biologie cellulaire
UE 72 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 3.2 : Physiologie végétale, dév. animal & végétal
UE 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 3.3 : Génétique, microbiologie ou géosciences
UE - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 3.4 : Compétences transversales
UE 50 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 4 SL2SVN
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- EP4.1.1 Métabolismes et enzymologie CM (Cours Magistral)24 h
- EP4.1.1 Métabolismes et enzymologie TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP4.1.1 Métabolismes et enzymologie TP (Travaux Pratiques)8 h
EP4.1.1 Métabolismes et enzymologie CM
Cours Magistral 24 h
En savoir plusEP4.1.1 Métabolismes et enzymologie TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP4.1.1 Métabolismes et enzymologie TP
Travaux Pratiques 8 h
En savoir plus -
- EP4.1.2 Biologie moléculaire CM (Cours Magistral)10 h
- EP4.1.2 Biologie moléculaire TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP4.1.2 Biologie moléculaire TP (Travaux Pratiques)4 h
EP4.1.2 Biologie moléculaire CM
Cours Magistral 10 h
En savoir plusEP4.1.2 Biologie moléculaire TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP4.1.2 Biologie moléculaire TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus
EP4.1.1 Métabolismes et enzymologie
Élément Constitutif 40 h - 5 Crédits ECTS
Objectifs : Appréhender les grandes voies métaboliques et leurs relations avec quelques grandes fonctions physiologiques.
En savoir plus
Comprendre les notions fondamentales de la cinétique enzymatique, notamment de la cinétique michaélienne, et de sa régulation par des inhibiteurs.
Contenu:
Cours :
Biochimie métabolique : Métabolisme des glucides, des lipides, des protéines: (glycolyse, voie des pentoses phosphates, néoglucogenèse, synthèse et dégradation des osides, biosynthèse et ß-oxydation des acides gras, cycle de Krebs... Métabolisme énergétique : présentation des divers types de métabolisme énergétique (phototrophie, chimiotrophie : respirations et fermentations), la respiration aérobie organotrophe dans la cellule eucaryote (la chaîne respiratoire mitochondriale, l’ATP-synthase, les phosphorylations oxydatives), la fermentation lactique, la fermentation alcoolique.
Enzymologie : Structure et propriétés des enzymes : Notion de catalyseur biologique - Le site actif (de la structure Iaire à la structure IIIaire des enzymes), notion de spécificité – Cofacteurs - Classification et nomenclature. Cinétique enzymatique : réaction élémentaire et ordre de réaction - Cinétique Michaélienne et détermination des paramètres cinétiques - Régulation de l’activité enzymatique : facteurs du milieu, inhibiteurs
TD : Cinétique Michaélienne (calcul des constantes) et exercices d’application du cours illustrant la relation métabolisme cellulaire et physiologie.
TP : Etude de la cinétique Michaélienne : détermination des paramètres cinétique de la phosphatase acide vis-à-vis d’un substrat - Utilisation de la spectrophotométrie en biochimie : détermination du coefficient d’extinction molaire, dosage du glucose par la glucose oxydase. Chromatographie en couches minces de glucides
EP4.1.2 Biologie moléculaire
Élément Constitutif 26 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
Introduire des stratégies fondamentales pour l’analyse et la manipulation de l’ADN et son utilisation comme ADN recombinant (clonage).
Montrer la liaison entre les découvertes en génétique et leurs applications en pratique, et comprendre les principes du travail pratique sur l'ADN.
Contenu:
Cours : Les acides nucléiques : l'influence de leur structure et leur séquence sur les manipulations en pratique - Les outils : les enzymes utilisés lors de la manipulation et analyse de l'ADN/ARN - Les vecteurs pour le clonage et l'expression de l'ADN recombinante - Les stratégies : comment fait-on pour analyse, isoler, et exprimer un gène - Les perspectives : introduction au séquençage NGS et les analyses haut debit -omics
TD : exercices sur les principes de manipulation enzymatique de l'ADN pour le clivage et clonage et caractérisation par analyse de restriction, PCR, et analyse de blots (Southern, Northern, Western)
TP : Analyse de restriction d'un plasmide
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- EP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal CM (Cours Magistral)18 h
- EP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal TP (Travaux Pratiques)10 h
EP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal CM
Cours Magistral 18 h
En savoir plusEP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP4.2a1 Biologie de la reproducion & du dev. animal TP
Travaux Pratiques 10 h
En savoir plus -
- EP4.2a2 Bio. de la reproducion & du développement végétal CM (Cours Magistral)19 h
- EP4.2a2 Bio. de la reproducion & du développement végétal TP (Travaux Pratiques)17 h
EP4.2a2 Bio. de la reproducion & du développement végétal CM
Cours Magistral 19 h
En savoir plusEP4.2a2 Bio. de la reproducion & du développement végétal TP
Travaux Pratiques 17 h
En savoir plus
EP4.2a1 Biologie de la reproducion & du developpement animal
Élément Constitutif 36 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Étudier les processus mis en jeu pour la Reproduction et le développement des vertébrés et des invertébrés
Contenu:
CM :
Biologie de la Reproduction animale : Les différents modes de reproduction chez les invertébrés et les vertébrés : reproduction asexuée et sexuée - Le processus de formation et de différenciation des gamètes chez les vertébrés, plus particulièrement chez les mammifères et les amphibiens : lignée germinale et gamétogenèse - Le contrôle endocrinien de la gamétogenèse : hormones hypophysaires et stéroïdiennes - Le mécanisme de la fécondation - L’infertilité mâle et femelle.
Biologie du développement animal : Les grandes étapes de l’embryogenèse chez les oiseaux et chez les mammifères - Les mécanismes de contrôle du développement embryonnaire : induction, régulations, processus morphogénétiques - L’organogenèse - Les annexes embryonnaires.
TD: Exercices approfondissant les CM.
TP : Mise en évidence des organes de la reproduction chez les vertébrés et les invertébrés. Observation et description du développement embryonnaire chez l’amphibien.
EP4.2a2 Bio. de la reproducion & du développement végétal
Élément Constitutif 36 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Connaitre et comprendre les mécanismes généraux du cycle de vie des Angiospermes, avec la germination de la graine, la mise en place et le fonctionnement de l’appareil végétatif, puis la reproduction avec la floraison et la production des graines et des fruits.
Contenu:
Cours : Développement et organisation morphologique des appareils aérien et racinaire. Diversité anatomique et fonctionnelle des différents types tissulaires ou cellulaires formés. Compréhension des mécanismes sous-jacents au développement et au fonctionnement de l'appareil reproducteur des angiospermes couvrant la floraison, les modes de pollinisations, la fécondation, l’organisation des fruits et des graines, ainsi que les stratégies de dissémination des espèces. Introduction aux clés de détermination des grandes familles de plantes.
TP : Anatomie des Angiospermes. Restitution graphique de l’observation des organes végétatifs des Monocotylédones et des Dicotylédones. Exploration de la reproduction des Angiospermes, depuis la fleur jusqu’au fruit et la germination de la graine : suivis morphologique et développemental. Initiation à la botanique à travers l’analyse florale
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- EP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie CM (Cours Magistral)10 h
- EP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie TP (Travaux Pratiques)6 h
EP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie CM
Cours Magistral 10 h
En savoir plusEP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie TP
Travaux Pratiques 6 h
En savoir plus -
- EP4.2b.2 Exploration du vivant : Outils d'analyse CM (Cours Magistral)12 h
- EP4.2b.2 Exploration du vivant : Outils d'analyse TD (Travaux Dirigés)12 h
EP4.2b.2 Exploration du vivant : Outils d'analyse CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP4.2b.2 Exploration du vivant : Outils d'analyse TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plus -
- EP4.2b.3 Exploration du vivant : Pharmacologie CM (Cours Magistral)14 h
- EP4.2b.3 Exploration du vivant : Pharmacologie TD (Travaux Dirigés)10 h
EP4.2b.3 Exploration du vivant : Pharmacologie CM
Cours Magistral 14 h
En savoir plusEP4.2b.3 Exploration du vivant : Pharmacologie TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plus
EP4.2b.1 Exploration du vivant : Méthodologie
Élément Constitutif 24 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Notions des principales étapes de purification, d’analyse et de quantification de composés biologiques
En savoir plus
Contenu:
Cours : Principes de purification, de détection et de quantification de composés biologiques. (principales techniques abordées : centrifugations, chromatographies, électrophorèses, Western Blot, dosage ELISA, dosage RIA, spectrophotométrie, spectrofluorime´trie, …).
TD : Application du cours sous forme d’exercices.
TP : Analyse protéique de composé biologique après séparation par électrophorèse et analyse par densitométrie.
EP4.2b.2 Exploration du vivant : Outils d'analyse
Élément Constitutif 24 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
Aborder les outils d’analyses pour explorer le vivant d’un point de vue microscopique par imagerie et moléculaire par spectrométrie.
Contenu:
Cours :
- Méthodes d’analyse spectroscopique : Spectroscopie par résonance magnétique nucléaire appliquées au vivant (in vivo et in vitro), Spectrométrie de masse.
- Méthodes d’imagerie (Microscopie optique et électronique).
TD :
– Spectroscopie analytique : analyse de spectres. Exemple d’application en biologie
– Modalités d’utilisation des différents types de microscopie et exercices d’application de la microscopie optique à fluorescence.
EP4.2b.3 Exploration du vivant : Pharmacologie
Élément Constitutif 24 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs : Comprendre les grands principes de la pharmacocinétique ie pouvoir suivre le devenir d'une substance de son lieu d’administration dans l'organisme jusqu’à son élimination. Cela permet d’estimer les variations de concentration d’une substance dues à la distribution d’une substance dans l’organisme, aux biotransformations subies et à son élimination.
En savoir plus
Contenu:
Cours :
Etude des processus de l’ADME (Absorption, Distribution, Métabolisme, et Élimination).
mots clés : Volume de distribution ; Temps de demi-vie d’absorption, plasmatique et d’élimination ; Interactions médicamenteuses ; Débit de filtration glomérulaire (DFG)...
TD :
Les TD s’appuient sur de nombreux exercices d’applications des CM.
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Module 4.2a : Biologie de la reproduction
Élément Constitutif 72 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 4.2b : Exploration du vivant
Élément Constitutif 72 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plus -
- Module 4.3 : Projet professionel (UE)8 Crédits ECTS
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- EP4.4.1 Anglais (Élément Constitutif)28 h - 2 Crédits ECTS
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- EP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM (Cours Magistral)2 h
- EP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD (Travaux Dirigés)6 h
- EP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP (Travaux Pratiques)6 h
EP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plusEP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP
Travaux Pratiques 6 h
En savoir plus - EP4.4.3 Ateliers Interdisciplinaires (Élément Constitutif)10 h - 2 Crédits ECTS
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- EP4.4.4 Compétences numériques (PIX) TD (Travaux Dirigés)14 h
- EP4.4.4 Compétences numériques (PIX) TP (Travaux Pratiques)4 h
EP4.4.4 Compétences numériques (PIX) TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plusEP4.4.4 Compétences numériques (PIX) TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus
EP4.4.1 Anglais
Élément Constitutif 28 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP4.4.2 Statistiques appliquées à la biologie
Élément Constitutif 14 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs Initiation aux outils statistiques
En savoir plus
Contenu:
Cours : Principales méthodes de statistiques descriptives (moyenne, médiane, variance, écart-type, mode, étendue, histogramme, boîte à moustache, régression linéaire) et inductives (test de Student sur 1 ou 2 échantillons, de corrélation, test du chi-2)
TD : Application à des jeux de données
TP : Logiciel R
EP4.4.3 Ateliers Interdisciplinaires
Élément Constitutif 10 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Cet enseignement a pour premier objectif de permettre aux étudiants de découvrir les liens qui existent entre les différentes disciplines enseignées en licence de Biologie et d’appréhender l’importance de cette interdisciplinarité dans le traitement de questions biologiques. Le rôle de cette intrication interdisciplinaire sera plus particulièrement illustré à travers des exemples mêlant chimie et biologie. Le second objectif de cette UE est consacré au renforcement des connaissances et de la maitrise de l’outil numérique par les étudiants. Il sera ainsi proposé aux étudiants de concevoir et réalisé une courte production numérique (vidéo) illustrant l’intérêt de combiner chimie et biologie dans le traitement de problématiques scientifiques et sociétales.
Contenu:
TD : Les étudiants travailleront autour de projets sélectionnés par l'équipe pédagogique combinant chimie et biologie. La démarche de conception doit impérativement comporter des phases de recherche et d'exploitation d’informations. Ce travail documentaire permet, à son tour, d'affiner la problématique et de décider du traitement le plus cohérent du sujet choisi. Sur cette base, les étudiants concevront un scénario traitant les points essentiels de leur sujet et réaliseront une vidéo de 5 min dans laquelle ils combineront présentation attractive et nouvelle de l’information scientifique avec une explication scientifique adaptée à des connaissances de licence.
Cet enseignement est effectué sous la direction d’enseignants chimistes et biologistes qui seront des personnes ressources tout au long de l’élaboration du projet.
EP4.4.4 Compétences numériques (PIX)
18 h
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Module 4.1 : Métabolisme et biologie moléculaire 2
UE 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 4.2 :Bio. de la reproduction ou exploration du vivant
UE - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 4.3 : Projet professionel
UE - 8 Crédits ECTS
Objectifs : Approfondissement scientifique sous la forme d’un tutorat d’un groupe d’étudiants par un enseignant et/ou chercheur.
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Contenu:
TD : Les étudiants doivent réaliser un mémoire en anglais sur une thématique scientifique spécifique. La réalisation de ce mémoire est encadrée par un enseignant ou un chercheur spécialiste du domaine choisi par les étudiants.
Une présentation orale en anglais devant un jury de scientifiques et d’enseignants en anglais finalisera le travail des étudiants. Un renforcement en anglais de 10h est dédié à l’aide à la réalisation du mémoire et de la présentation orale.
Module 4.4 : Compétences transversales
UE 60 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 5
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- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TP (Travaux Pratiques)16 h
EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TP
Travaux Pratiques 16 h
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- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique CM (Cours Magistral)24 h
- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique CM
Cours Magistral 24 h
En savoir plusEP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TP
Travaux Pratiques 8 h
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EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Cet enseignement est une première approche des grands thèmes d’écologie des populations et de biodiversité ainsi que les applications possibles à la conservation des populations.
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Contenu:
Cours : seront abordés les principaux paramètres biodémographiques - la modélisation de la croissance d’une population dans différentes situations de développement en temps discret et continu et les interactions entre populations (par exemple : compétition et prédation). La biologie de la conservation sera abordée par l’étude de concepts liés à l’utilisation des outils génétiques pour recenser la biodiversité et décrire les interactions biotiques. En particulier les méthodes de "code barre" ADN, de metabarcoding ADN et l’utilisation d’ADN environnemental seront abordées. L’impact des espèces invasives ainsi que l’impact de l’anthropisation et la disparition des habitats naturels seront également discutés à travers l’étude ce certains projets de recherche.
TD/TP : Utilisation des outils mathématiques et statistiques (utilisation du logiciel R) en biologie des populations, construction et interprétation d’une table de vie.
Mise en place de protocoles pour recenser la biodiversité à l’aise d’outils génétiques, utilisation des bases de données génétiques en ligne (BOLD et Genbank), utilisation d’outils informatiques pour l’analyse de données génétiques de type barcode et metabarcode. Application des indices de biodiversités à des jeux de données génétiques.
EP5.1.2b Réponses des plantes à leur environnement abiotique
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Comprendre ce qu’est la plasticité phénotypique, en quoi elle est importante chez les plantes, les facteurs qui peuvent la déclencher et la manière dont elle peut être mise en œuvre, à l’aide d’exemples concrets. 1) Comprendre les mécanismes de perception de la lumière et la façon dont celle-ci impacte certains processus développementaux des plantes. 2) Appréhender les mécanismes physiologiques et moléculaires déclenchés chez les plantes en réponse à des perturbations de leur environnement abiotique (stress hydrique, basse température, salin) et qui leur permettent ou non de tolérer ou s’acclimater à ces contraintes. Être en mesure de proposer des voies d’amélioration de la tolérance aux contraintes abiotiques. 3) Comprendre les différents types d’interaction existant entre les plantes et leurs conséquences sur l’accessibilité aux ressources.
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Contenu:
Cours : Adaptation de la morphologie, de l’anatomie, du métabolisme et de la phénologie des plantes, i.e. la plasticité phénotypique, en réponse à des perturbations de leur environnement dans le contexte de la réponse à l’ombrage, de l’hétérophyllie ou encore de la réponse du système racinaire aux nutriments disponibles. Etude des différents types de photorécepteurs chez les plantes (structure, fonctionnement), ainsi que les différents processus qu’ils contrôlent. Physiologie des stress abiotiques et mécanismes de tolérance et d’acclimatation mis en place en réponse à ces contraintes. Interactions antagonistes (compétition, parasitisme) ou facilitatrices (coopération) entre plantes : exemple des cultures en association.
TD : Approfondissement des cours par l’analyse de publications scientifiques sur des végétaux d’intérêts.
TP : Analyse des perturbations géniques déclenchées par les stress abiotiques via une analyse bioinformatique de bases de données
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- EP5.1.1 Génétique des populations CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.1.1 Génétique des populations TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.1.1 Génétique des populations TP (Travaux Pratiques)4 h
EP5.1.1 Génétique des populations CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations TP
Travaux Pratiques 4 h
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Choix EP2 M5.1
40 h - 4 Crédits ECTS
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs :
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Cet enseignement a pour objectifs d’initier les étudiants aux principaux concepts de la génétique des populations, et de ses applications dans la recherche scientifique visant notamment à comprendre la structure et la dynamique de la diversité génétique au sein des populations naturelles animales et végétales. Maîtrise des principaux concepts de la génétique des populations, et de ses applications en écologie et biologie de la conservation
Connaissances sur le polymorphisme et certains marqueurs moléculaires : définitions, principes et méthodes d’analyse en biologie moléculaire et génomique
Notions de modèle théorique en écologie, modélisation mathématique, biomathématique, lois de probabilités et statistiques
Contenu:
CM : Les cours se structurent en trois parties :
1) Organisation génétique des populations
Les composantes de la structure génétique des populations, fréquences alléliques et génotypiques, le modèle de Hardy-Weinberg, l’influence du régime de reproduction, panmixie, autogamie, consanguinité et dépression de consanguinité
2) Forces évolutives des populations
Modèles de mutation, de migration, modèle de sélection directionnelle de viabilité, la dérive génétique et ses conséquences, étude des équilibres de fréquences alléliques, notion de différenciation génétique entre populations
3) Mécanismes de maintien du polymorphisme dans les populations
Importance du polymorphisme, le modèle mutation-sélection, avantage sélectif aux hétérozygotes, valeurs sélectives variables, modèles de sélection fréquence-dépendante et modèles multi-niches, le polymorphisme transitoire, théorie neutre de l’évolution moléculaire
TD : Applications des principaux concepts de génétique des populations vus en cours par la résolution d’exercices -
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- EP5.2.1 Relations plantes organismes CM (Cours Magistral)26 h
- EP5.2.1 Relations plantes organismes TD (Travaux Dirigés)14 h
- EP5.2.1 Relations plantes organismes TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.2.1 Relations plantes organismes CM
Cours Magistral 26 h
En savoir plusEP5.2.1 Relations plantes organismes TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plusEP5.2.1 Relations plantes organismes TP
Travaux Pratiques 8 h
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- EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire TP (Travaux Pratiques)18 h
EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire TP
Travaux Pratiques 18 h
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EP5.2.1 Relations plantes organismes
Élément Constitutif 48 h - 5 Crédits ECTS
Objectifs : Cet enseignement propose une approche intégrative des concepts cellulaires, biochimiques et moléculaires afin de permettre aux étudiants de saisir les processus physiologiques sous-jacents à l'adaptation des plantes face aux pressions biotiques de leur environnement. Nous explorerons la coévolution entre les plantes et les animaux, comme l'imitation de la femelle d'un insecte par une fleur pour attirer les pollinisateurs, ainsi que les mécanismes de défense des plantes contre les micro-organismes pathogènes, en abordant les gènes de résistance et les stratégies de lutte biologique. Nous nous pencherons également sur les mécanismes de défense contre les herbivores, notamment les mécanismes moléculaires associées à cette interaction. Ce cours vise à développer les compétences d'analyse intégrative en biochimie et en biologie moléculaire, ainsi que la maîtrise des techniques de dosage physicochimique telles que la chromatographie en phase gazeuse. Dans le cadre des TPs, une attention sera portée sur l'utilisation de l'outil informatique R pour l'analyse avancée des données. Les étudiants auront ainsi l'opportunité d'acquérir une expertise approfondie dans ces domaines, renforçant ainsi leurs compétences analytiques et leur capacité à interpréter les résultats de manière rigoureuse et précise.
En savoir plusEP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire
Élément Constitutif 20 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs
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Cet enseignement pratique immersif de 3 jours vise à développer les compétences expérimentales des étudiant.e.s mais aussi leur capacité à s’approprier un sujet de recherche, de s’impliquer dans les choix expérimentaux en fonction des problématiques traitées et enfin de travailler sur la mise en forme et l’interprétation de leurs résultats. Les connaissances acquises tout au long du cursus de licence seront exploitées dans cet enseignement qui se veut transdisciplinaire (terrain et collecte de spécimens adaptée à la question biologique, biologie moléculaire, biochimie, physiologie, approches haut débit, utilisation de bases de données publiques…).
Contenu:
Cours : Présentation du thème développer dans le TP sur les interactions des plantes avec les insectes en tant que vecteur de dispersion des virus. Le contexte scientifique sera exposé afin d’identifier des problématiques d’intérêts liées à ce sujet de recherche. Enfin, les diverses possibilités et le choix des outils expérimentaux qui seront mise en œuvre pendant le TP pour répondre à ces problématiques seront discutés.
TP : Mise en œuvre des outils expérimentaux retenus pendant le cours (ex : Barcoding, ELISA…), mise en forme des résultats et interprétation.
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- EP5.3.1 Ecologie sensorielle CM (Cours Magistral)12 h
- EP5.3.1 Ecologie sensorielle TD (Travaux Dirigés)6 h
- EP5.3.1 Ecologie sensorielle TP (Travaux Pratiques)12 h
EP5.3.1 Ecologie sensorielle CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP5.3.1 Ecologie sensorielle TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plusEP5.3.1 Ecologie sensorielle TP
Travaux Pratiques 12 h
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- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TD (Travaux Dirigés)10 h
- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TP (Travaux Pratiques)12 h
EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plusEP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TP
Travaux Pratiques 12 h
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EP5.3.1 Ecologie sensorielle
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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L’objectif du module est de comprendre comment les organismes obtiennent, traitent, intègrent et utilisent les informations provenant de leur environnement pour localiser des ressources importantes pour leur survie.
Contenu :
Cours : Présentation des principes généraux de l’organisation morphologique, fonctionnement et évolution des divers systèmes sensoriels (visuel, chimique, mécanique, thermique, électrique, magnétique).
TD : Discussion et questionnaires pour réviser et consolider les connaissances acquis en CM.
TP : Expériences en laboratoire pour illustrer et consolider les principes de fonctionnement des divers systèmes sensorielles, en particulier sur l’Homme et des modèles animaux choisis.
EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale
Élément Constitutif 38 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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Connaitre les structures anatomiques et les grandes fonctions chez les animaux, a fin de comprendre la relation entre structure et fonction. Étudier l’anatomie et la physiologie de manière comparée.
Contenu:
Cours : Présentation des structures associées à des fonctions principales : circulation, respiration, digestion, locomotion, soutien. Les structures anatomiques et les fonctionnalités seront étudiées de manière comparée et évolutive.
TD : Une des séances TD se tiendra au Muséum d’Histoire Naturelle de Tours où les aspects professionnels du travail au Muséum seront présentés : fonctionnement administrative, aspects juridiques, conservation du matériel, pédagogie. Les autres TD seront consacrés à la discussion sur les aspects comparatives et fonctionnelle de l’organisation anatomique des animaux.
TP : Appliquer les connaissances dans les travaux pratiques. Observation des spécimens conservés et vivants, afin de comparer leur anatomie et comprendre celle-ci en termes de phylogénie et le mode de vie des différents groupes d’animaux.
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- EP5.4.1 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM (Cours Magistral)3 h
- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD (Travaux Dirigés)4 h
- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP (Travaux Pratiques)5 h
EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM
Cours Magistral 3 h
En savoir plusEP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD
Travaux Dirigés 4 h
En savoir plusEP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP
Travaux Pratiques 5 h
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- EP5.4.3 Outils moléculaires CM (Cours Magistral)6 h
- EP5.4.3 Outils moléculaires TD (Travaux Dirigés)14 h
EP5.4.3 Outils moléculaires CM
Cours Magistral 6 h
En savoir plusEP5.4.3 Outils moléculaires TD
Travaux Dirigés 14 h
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- EP5.4.4 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.4.4 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP5.4.4 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.4.4 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
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EP5.4.1 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : A partir de données récoltées, par exemple lors de stages, d’expériences en TP ou de sortie de terrain, les étudiants devront savoir quel test statistique appliquer en fonction du type de données obtenues (quantitatives, qualitatives, …) et comment l’utiliser pour pouvoir valider ou non leurs hypothèses et répondre à une question posée.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Test du ?2 - Tests non paramétriques de comparaison de 2 échantillons indépendants : Test des médianes, Mann-Whitney, Kolmogorov-Smirnov.
TD : Applications de ces tests non paramétriques à des jeux de données.
TP : Utilisation du logiciel R pour ces tests non paramétriques.
EP5.4.3 Outils moléculaires
Élément Constitutif 20 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Cet EP a pour objectif que les étudiants acquièrent les bases de biologie cellulaire et moléculaire en continuité des modules de L2SV et les techniques de biologie moléculaire nécessaires à l’étude des écosystèmes.
Contenu
Cours : Notions nécessaires à la compréhension des mécanismes de la régulation transcriptionnelle (3h) – Outils de biologie moléculaire : PCR, RT-PCR, Western-blot, ELISA, NGS (RNAseq-Métagénomique-DNA environnemental) (3h)
TD : Exercices d’applications des notions vues en cours et analyse de résultats expérimentaux issus de publications scientifiques. Présentation de résultats expérimentaux et communication scientifique.
EP5.4.4 Mobil
4 h
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Module 5.1 : Génétique des populations/Ecologie ou réponse
UE 72 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.2 : Relations plantes- organismes et projet
UE 68 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.3 : Anatomie-Physiologie animale et Ecologie
UE 68 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.4 : Compétences transversales
UE 54 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 5
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- 5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire CM (Cours Magistral)18 h
- 5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire TD (Travaux Dirigés)12 h
5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire CM
Cours Magistral 18 h
En savoir plus5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire TD
Travaux Dirigés 12 h
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- 5.1.2 Immunologie CM (Cours Magistral)12 h
- 5.1.2 Immunologie TD (Travaux Dirigés)6 h
- 5.1.2 Immunologie TP (Travaux Pratiques)4 h
5.1.2 Immunologie CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plus5.1.2 Immunologie TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plus5.1.2 Immunologie TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus -
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie CM (Cours Magistral)3 h
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TD (Travaux Dirigés)4 h
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TP (Travaux Pratiques)5 h
5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie CM
Cours Magistral 3 h
En savoir plus5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TD
Travaux Dirigés 4 h
En savoir plus5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TP
Travaux Pratiques 5 h
En savoir plus
5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Cette EP permettra aux étudiants d’acquérir des notions disciplinaires approfondies de Biologie cellulaire et moléculaire ainsi que les méthodes d’analyse de résultats expérimentaux.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Organisation des génomes et structures des chromosomes eucaryotes. Voies de transduction de signal. Régulation épigénétique, transcriptionnelle, post-transcriptionnelle, traductionnelle de l’expression des gènes. Régulation du cycle cellulaire
TD : Analyse de résultats expérimentaux issus d’articles scientifiques en anglais illustrant les notions scientifiques vues en cours
5.1.2 Immunologie
Élément Constitutif 22 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Découvrir les bases fondamentales de l’immunologie, ses concepts moléculaires ainsi que ses acteurs humoraux et cellulaires. Il s’agit de comprendre la dynamique des réponses immunitaires innées et adaptatives ainsi que certaines fonctions effectrices permettant l’élimination de l’agent pathogène. Des notions d’immunothérapies seront également abordées. Les TD et TP permettront aux étudiants d’appréhender les méthodologies d’exploration des réponses immunitaires développées à des fins de recherche fondamentale et pour le diagnostic clinique.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Les organes du système immunitaire, Les acteurs moléculaires et cellulaires impliqués lors des réponses immunitaires innées et adaptatives
TD : Description des techniques utilisées en immunologie clinique et en recherche fondamentale - Exercices d’application
TP : Observation de cellules immunitaires et mise en évidence d’une réaction antigènes/anticorps
5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : A partir de données récoltées, par exemple lors de stages, d’expériences en TP ou de sortie de terrain, les étudiants devront savoir quel test statistique appliquer en fonction du type de données obtenues (quantitatives, qualitatives, …) et comment l’utiliser pour pouvoir valider ou non leurs hypothèses et répondre à une question posée.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Test du ?2 - Tests non paramétriques de comparaison de 2 échantillons indépendants : Test des médianes, Mann-Whitney, Kolmogorov-Smirnov.
TD : Applications de ces tests non paramétriques à des jeux de données.
TP : Utilisation du logiciel R pour ces tests non paramétriques.
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- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule CM (Cours Magistral)26 h
- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TD (Travaux Dirigés)28 h
- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule CM
Cours Magistral 26 h
En savoir plusEP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TD
Travaux Dirigés 28 h
En savoir plusEP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TP
Travaux Pratiques 8 h
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- EP5.2b Virologie CM (Cours Magistral)30 h
- EP5.2b Virologie TD (Travaux Dirigés)18 h
- EP5.2b Virologie TP (Travaux Pratiques)14 h
EP5.2b Virologie CM
Cours Magistral 30 h
En savoir plusEP5.2b Virologie TD
Travaux Dirigés 18 h
En savoir plusEP5.2b Virologie TP
Travaux Pratiques 14 h
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- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires CM (Cours Magistral)30 h
- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TP (Travaux Pratiques)20 h
EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires CM
Cours Magistral 30 h
En savoir plusEP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TP
Travaux Pratiques 20 h
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EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
Cette UE a pour objectif de donner aux étudiants les outils nécessaires pour l’analyse moléculaire de processus biologiques par l’élaboration de plans expérimentaux pouvant conduire à la rédaction d’un projet. Cette démarche intégrée est applicable aussi bien à l’étude d’une population, qu’au fonctionnement d’un tissu, d’une cellule procaryote ou d’une cellule eucaryote.
Contenu :
Cours : Technologies d’analyse de l’ADN (hybridation, PCR, séquençage, bio-informatique). Stratégies d’analyse moléculaire utilisant l’ADN (marqueurs moléculaires, clonage, base de données, empreintes génétiques, marqueurs épigénétiques, séquençage haut-débit) et de la modification des génomes (RNAi, CRISPR-Cas9). Protocoles expérimentaux pour l’étude de la production et la détection d’ARN -Le monde des petits ARN application aux cancers - Protocoles expérimentaux pour l’étude de la production et la détection des protéines - Étude des interactions acides nucléiques/protéines - Biotechnologie, Thérapie cellulaire et génique- Conceptualisation, mise en place d’un projet expérimental.
TD : Analyse de résultats expérimentaux et analyse d’articles en anglais illustrant les notions développées en cours. Mise en place de projets expérimentaux pour répondre à des questions scientifiques et réflexions sur les résultats attendus. Production d’un poster et d’un résumé type colloque sur une thématique scientifique et exposition dans les locaux de la faculté des sciences.
TP : Recherche d’informations sur un gène dans les bases de données web et construction d’un plan expérimental informatique pour l’expression d’un gène en cellules eucaryotes.
EP5.2b Virologie
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Maîtriser la diversité des cycles de multiplication des virus et intégrer le déroulement d’une infection virale et ses mécanismes de régulation. Savoir analyser, mobiliser ses connaissances, communiquer et s’ouvrir à un travail collaboratif notamment à travers la présentation d’articles donnés en langue anglaise en groupe.
Contenu:
Cours : Cycle de réplication virale et particularité des grandes familles virales – Diversité, organisation et évolution des génomes viraux
TD : Applications du cours sous forme de présentation d'articles et d’exercices..
TP : Expression d’une protéine recombinante dans un système baculovirus-cellules d’insectes.
Pré-requis : avoir suivi un enseignement de microbiologie générale et si possible de génétique et/ou de biologie moléculaire et cellulaire.
EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Comprendre et se familiariser avec les grands principes de la physiologie impliquant les voies circulatoires et les vaisseaux sanguins en particulier. Seront enseignés les mécanismes de régulation dans des contextes physiologique et pathologique. Les exemples porteront sur les mammifères et notamment l'Homme.
Contenu:
Cours :
Physiologie vasculaire : Caractéristique de la cellule musculaire lisse vasculaire, couplage excitation-contraction et contrôle de l’appareil contractile.
Pathologies vasculaires : Rôle des vaisseaux sanguins dans des conditions pathologiques (resténose, hypertension, cancer…)
TP : Activité contractile du muscle lisse vasculaire et simulation informatique des voies d’entrées du calcium.
TD : A partir d’exemples, les enseignements rassemblent des exercices d’application des cours, des études de cas pathologiques et une préparation aux TP.
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- EP5.3a Bactériologie CM (Cours Magistral)38 h
- EP5.3a Bactériologie TD (Travaux Dirigés)18 h
- EP5.3a Bactériologie TP (Travaux Pratiques)10 h
EP5.3a Bactériologie CM
Cours Magistral 38 h
En savoir plusEP5.3a Bactériologie TD
Travaux Dirigés 18 h
En savoir plusEP5.3a Bactériologie TP
Travaux Pratiques 10 h
En savoir plus -
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- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TP
Travaux Pratiques 8 h
En savoir plus -
- EP5.3b.2 Neuro-anatomie CM (Cours Magistral)20 h
- EP5.3b.2 Neuro-anatomie TD (Travaux Dirigés)10 h
EP5.3b.2 Neuro-anatomie CM
Cours Magistral 20 h
En savoir plusEP5.3b.2 Neuro-anatomie TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plus
EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2
Élément Constitutif 36 h - 4 Crédits ECTS
Contenu:
En savoir plus
Cours : Physiologie rénale – Physiologie cardiaque – Physiologie respiratoire – Régulation de la pression artérielle – Régulation hydrique et acido-basique. Régulation électrolytique
TD : Exercices sur les méthodes d'étude en physiologie et les différentes régulations (hydrique, acido-basique) – Étude de cas pathologiques
TP : Mesure des paramètres physiologiques humains : mesure du pouls et de la pression artérielle – spirométrie – Réalisation d’un ECG- Mesure des différents paramètres lors d’un exercice physique.
EP5.3b.2 Neuro-anatomie
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Contenu:
En savoir plus
Cours : Bases neuro-anatomiques, fonctionnelles et cliniques du système nerveux central. Enseignement séquencé en six chapitres : 1. Généralités ; 2. Moelle spinale ; 3. Tronc cérébral ; 4. Cervelet ; 5. Cerveau ; 6. Synthèses. A travers ces chapitres, les bases neurobiologiques de la perception somato-sensorielle et de la motricité somatique seront abordées.
TD : 1. Évolution du SNC, 2. Développement du SNC, 3. Motricité somatique, 4. Système neurovégétatif, 5. Exercice de neuro-anatomie clinique - révisions
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- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions CM (Cours Magistral)38 h
- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TD (Travaux Dirigés)19 h
- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TP (Travaux Pratiques)9 h
EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions CM
Cours Magistral 38 h
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TD
Travaux Dirigés 19 h
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TP
Travaux Pratiques 9 h
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EP5.3a Bactériologie
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
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Approfondir les connaissances sur la physiologie et le mode de vie des bactéries et sur la régulation de l’expression de leur génome, acquérir les concepts et approches techniques biochimiques et moléculaires pour l’identification des bactéries, intégrer le rôle des bactéries dans l’infectiologie, comprendre les relations entre les bactéries et leurs environnements. Trouver l’information pertinente, exploiter ses connaissances et développer son analyse notamment à travers l’étude de cas cliniques
Contenu:
Cours :
Bactériologie : Identification phénotypique et génotypique des bactéries - Bactéries et santé (Quorum sensing, biofilm, pathogénicité, facteur de virulence, antibactériens) - Génie microbiologique - Cytosquelette et Histone-like - Organisation du génome des procaryotes ; particularités - Plasmides, éléments génétiques mobiles - Variations, mutations – microbiotes et leur importance.
Parasitologie : diversité des parasites et exemples de cycles parasitaires
TD : Applications du cours sous forme d'exercices - Etude de cas clinique - Présentation d'articles en langue française
TP : Synthèse de biofilm - CMI/CMB/Antibiogramme - Sélection de mutants.
Pré-requis : avoir suivi un enseignement de microbiologie générale.
EP5.3b Physiologie des régulations 2 et Neuro-anatomie
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
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Cet enseignement a pour but d’apporter aux étudiants des connaissances solides dans le domaine de la biochimie générale. Seront développés les aspects structuraux des principales classes de biomolécules (protéines, sucres, lipides) en relation avec leur fonction biologique ainsi que des éléments d’enzymologie générale. Les compétences acquises dans ce module permettront aux étudiants d’avoir une meilleure compréhension des phénomènes biologiques au niveau moléculaire.
Contenu:
Cours :
Structure et fonction des protéines: acides aminés comme constituants des protéines, éléments de chimie des protéines, méthode d’étude des séquences, les différents niveaux d’organisation structurale, méthodes de détermination des structures 3D, relations structure-fonction, assemblages protéiques supramoléculaires : exemples des virus sphériques
- Sucres et glycoconjugués: Structure et fonctions des oses simples et des glycoconjugués (protéoglycanes et glycoprotéines). Métabolisme des glycoprotéines. Rôle des glycoconjugués et des lectines dans les mécanismes de reconnaissances cellulaires
- Lipides et membranes: Constituants membranaires et principes de l’organisation membranaire, Transports membranaires
- Enzymologie générale: Nomenclature et classification, spécificité d'action des enzymes, cinétique des réactions à un substrat, mesure des activités enzymatiques, cinétique des réactions enzymatiques en présence d’inhibiteurs.
TD : Exercices d’application portant sur : spectrophotométrie, structure des protéines, équilibres acido-basiques et solutions tampons, cinétique enzymatique
TP : Étude fonctionnelle d’une protéase à sérine
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- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire CM (Cours Magistral)1 h
- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TD (Travaux Dirigés)10 h
- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TP (Travaux Pratiques)29 h
EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire CM
Cours Magistral 1 h
En savoir plusEP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plusEP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TP
Travaux Pratiques 29 h
En savoir plus - EP5.4.2 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP5.4.3 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.4.3 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP5.4.3 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.4.3 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
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EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs Cette EP a pour but de sensibiliser les étudiants aux moyens de traiter une question biologique par l’élaboration de stratégies d’analyses, la mise en œuvre de méthodologies expérimentales complémentaires faisant appel à plusieurs champs disciplinaires, la présentation et l’analyse de leurs résultats en adoptant une démarche scientifique, tout en considérant la biologie de manière intégrée, de l’organisme à la molécule.
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Contenu:
La problématique scientifique repose sur l’analyse d’une thématique sous différents aspects : physiologique, bactériologique, génétique, moléculaire et biochimique.
CM : Présentation générale du modèle d’étude et identification de problématiques scientifiques associées.
TD : Outils à mettre en œuvre pour répondre à une question scientifique. Données pratiques à prendre en compte (calculs de dilution, molarité, dilution sérielle…). Présentation de résultats à l’identique d’une publication : droite étalon, histogrammes, résultats de gel. Méthodes d’analyse de résultats dans une démarche scientifique.
TP : L’organisation de ce TP se fera sur la base de 18 étudiants par groupe, encadré par 1 enseignant. Le TP sera effectué sur une semaine en continu afin de mettre les étudiants en situation de mener et contrôler leur projet scientifique, de l’élaboration à l’analyse des résultats.
EP5.4.2 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
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L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP5.4.3 Mobil
4 h
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Module 5.1 : Biologie cellulaire, Immunologie, Statistiques
UE 64 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.2 : Compétences disciplinaires BS 1
UE 62 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.3 : Compétences disciplinaires BS 2
UE 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.4 : Compétences transversales
UE 62 h - 6 Crédits ECTS
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- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TP (Travaux Pratiques)16 h
EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP5.1.2a Ecologie-Biodiversité TP
Travaux Pratiques 16 h
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- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique CM (Cours Magistral)24 h
- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TD (Travaux Dirigés)8 h
- EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique CM
Cours Magistral 24 h
En savoir plusEP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TD
Travaux Dirigés 8 h
En savoir plusEP5.1.2b Réponses plantes à leur environnement abiotique TP
Travaux Pratiques 8 h
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EP5.1.2a Ecologie-Biodiversité
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Cet enseignement est une première approche des grands thèmes d’écologie des populations et de biodiversité ainsi que les applications possibles à la conservation des populations.
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Contenu:
Cours : seront abordés les principaux paramètres biodémographiques - la modélisation de la croissance d’une population dans différentes situations de développement en temps discret et continu et les interactions entre populations (par exemple : compétition et prédation). La biologie de la conservation sera abordée par l’étude de concepts liés à l’utilisation des outils génétiques pour recenser la biodiversité et décrire les interactions biotiques. En particulier les méthodes de "code barre" ADN, de metabarcoding ADN et l’utilisation d’ADN environnemental seront abordées. L’impact des espèces invasives ainsi que l’impact de l’anthropisation et la disparition des habitats naturels seront également discutés à travers l’étude ce certains projets de recherche.
TD/TP : Utilisation des outils mathématiques et statistiques (utilisation du logiciel R) en biologie des populations, construction et interprétation d’une table de vie.
Mise en place de protocoles pour recenser la biodiversité à l’aise d’outils génétiques, utilisation des bases de données génétiques en ligne (BOLD et Genbank), utilisation d’outils informatiques pour l’analyse de données génétiques de type barcode et metabarcode. Application des indices de biodiversités à des jeux de données génétiques.
EP5.1.2b Réponses des plantes à leur environnement abiotique
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Comprendre ce qu’est la plasticité phénotypique, en quoi elle est importante chez les plantes, les facteurs qui peuvent la déclencher et la manière dont elle peut être mise en œuvre, à l’aide d’exemples concrets. 1) Comprendre les mécanismes de perception de la lumière et la façon dont celle-ci impacte certains processus développementaux des plantes. 2) Appréhender les mécanismes physiologiques et moléculaires déclenchés chez les plantes en réponse à des perturbations de leur environnement abiotique (stress hydrique, basse température, salin) et qui leur permettent ou non de tolérer ou s’acclimater à ces contraintes. Être en mesure de proposer des voies d’amélioration de la tolérance aux contraintes abiotiques. 3) Comprendre les différents types d’interaction existant entre les plantes et leurs conséquences sur l’accessibilité aux ressources.
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Contenu:
Cours : Adaptation de la morphologie, de l’anatomie, du métabolisme et de la phénologie des plantes, i.e. la plasticité phénotypique, en réponse à des perturbations de leur environnement dans le contexte de la réponse à l’ombrage, de l’hétérophyllie ou encore de la réponse du système racinaire aux nutriments disponibles. Etude des différents types de photorécepteurs chez les plantes (structure, fonctionnement), ainsi que les différents processus qu’ils contrôlent. Physiologie des stress abiotiques et mécanismes de tolérance et d’acclimatation mis en place en réponse à ces contraintes. Interactions antagonistes (compétition, parasitisme) ou facilitatrices (coopération) entre plantes : exemple des cultures en association.
TD : Approfondissement des cours par l’analyse de publications scientifiques sur des végétaux d’intérêts.
TP : Analyse des perturbations géniques déclenchées par les stress abiotiques via une analyse bioinformatique de bases de données
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- EP5.1.1 Génétique des populations CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.1.1 Génétique des populations TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.1.1 Génétique des populations TP (Travaux Pratiques)4 h
EP5.1.1 Génétique des populations CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations TP
Travaux Pratiques 4 h
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Choix EP2 M5.1
40 h - 4 Crédits ECTS
En savoir plusEP5.1.1 Génétique des populations
Élément Constitutif 32 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs :
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Cet enseignement a pour objectifs d’initier les étudiants aux principaux concepts de la génétique des populations, et de ses applications dans la recherche scientifique visant notamment à comprendre la structure et la dynamique de la diversité génétique au sein des populations naturelles animales et végétales. Maîtrise des principaux concepts de la génétique des populations, et de ses applications en écologie et biologie de la conservation
Connaissances sur le polymorphisme et certains marqueurs moléculaires : définitions, principes et méthodes d’analyse en biologie moléculaire et génomique
Notions de modèle théorique en écologie, modélisation mathématique, biomathématique, lois de probabilités et statistiques
Contenu:
CM : Les cours se structurent en trois parties :
1) Organisation génétique des populations
Les composantes de la structure génétique des populations, fréquences alléliques et génotypiques, le modèle de Hardy-Weinberg, l’influence du régime de reproduction, panmixie, autogamie, consanguinité et dépression de consanguinité
2) Forces évolutives des populations
Modèles de mutation, de migration, modèle de sélection directionnelle de viabilité, la dérive génétique et ses conséquences, étude des équilibres de fréquences alléliques, notion de différenciation génétique entre populations
3) Mécanismes de maintien du polymorphisme dans les populations
Importance du polymorphisme, le modèle mutation-sélection, avantage sélectif aux hétérozygotes, valeurs sélectives variables, modèles de sélection fréquence-dépendante et modèles multi-niches, le polymorphisme transitoire, théorie neutre de l’évolution moléculaire
TD : Applications des principaux concepts de génétique des populations vus en cours par la résolution d’exercices -
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- EP5.2.1 Relations plantes organismes CM (Cours Magistral)26 h
- EP5.2.1 Relations plantes organismes TD (Travaux Dirigés)14 h
- EP5.2.1 Relations plantes organismes TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.2.1 Relations plantes organismes CM
Cours Magistral 26 h
En savoir plusEP5.2.1 Relations plantes organismes TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plusEP5.2.1 Relations plantes organismes TP
Travaux Pratiques 8 h
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- EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire TP (Travaux Pratiques)18 h
EP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire TP
Travaux Pratiques 18 h
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EP5.2.1 Relations plantes organismes
Élément Constitutif 48 h - 5 Crédits ECTS
Objectifs : Cet enseignement propose une approche intégrative des concepts cellulaires, biochimiques et moléculaires afin de permettre aux étudiants de saisir les processus physiologiques sous-jacents à l'adaptation des plantes face aux pressions biotiques de leur environnement. Nous explorerons la coévolution entre les plantes et les animaux, comme l'imitation de la femelle d'un insecte par une fleur pour attirer les pollinisateurs, ainsi que les mécanismes de défense des plantes contre les micro-organismes pathogènes, en abordant les gènes de résistance et les stratégies de lutte biologique. Nous nous pencherons également sur les mécanismes de défense contre les herbivores, notamment les mécanismes moléculaires associées à cette interaction. Ce cours vise à développer les compétences d'analyse intégrative en biochimie et en biologie moléculaire, ainsi que la maîtrise des techniques de dosage physicochimique telles que la chromatographie en phase gazeuse. Dans le cadre des TPs, une attention sera portée sur l'utilisation de l'outil informatique R pour l'analyse avancée des données. Les étudiants auront ainsi l'opportunité d'acquérir une expertise approfondie dans ces domaines, renforçant ainsi leurs compétences analytiques et leur capacité à interpréter les résultats de manière rigoureuse et précise.
En savoir plusEP5.2.2 Projet expérimental transdisciplinaire
Élément Constitutif 20 h - 3 Crédits ECTS
Objectifs
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Cet enseignement pratique immersif de 3 jours vise à développer les compétences expérimentales des étudiant.e.s mais aussi leur capacité à s’approprier un sujet de recherche, de s’impliquer dans les choix expérimentaux en fonction des problématiques traitées et enfin de travailler sur la mise en forme et l’interprétation de leurs résultats. Les connaissances acquises tout au long du cursus de licence seront exploitées dans cet enseignement qui se veut transdisciplinaire (terrain et collecte de spécimens adaptée à la question biologique, biologie moléculaire, biochimie, physiologie, approches haut débit, utilisation de bases de données publiques…).
Contenu:
Cours : Présentation du thème développer dans le TP sur les interactions des plantes avec les insectes en tant que vecteur de dispersion des virus. Le contexte scientifique sera exposé afin d’identifier des problématiques d’intérêts liées à ce sujet de recherche. Enfin, les diverses possibilités et le choix des outils expérimentaux qui seront mise en œuvre pendant le TP pour répondre à ces problématiques seront discutés.
TP : Mise en œuvre des outils expérimentaux retenus pendant le cours (ex : Barcoding, ELISA…), mise en forme des résultats et interprétation.
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- EP5.3.1 Ecologie sensorielle CM (Cours Magistral)12 h
- EP5.3.1 Ecologie sensorielle TD (Travaux Dirigés)6 h
- EP5.3.1 Ecologie sensorielle TP (Travaux Pratiques)12 h
EP5.3.1 Ecologie sensorielle CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plusEP5.3.1 Ecologie sensorielle TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plusEP5.3.1 Ecologie sensorielle TP
Travaux Pratiques 12 h
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- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TD (Travaux Dirigés)10 h
- EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TP (Travaux Pratiques)12 h
EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plusEP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale TP
Travaux Pratiques 12 h
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EP5.3.1 Ecologie sensorielle
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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L’objectif du module est de comprendre comment les organismes obtiennent, traitent, intègrent et utilisent les informations provenant de leur environnement pour localiser des ressources importantes pour leur survie.
Contenu :
Cours : Présentation des principes généraux de l’organisation morphologique, fonctionnement et évolution des divers systèmes sensoriels (visuel, chimique, mécanique, thermique, électrique, magnétique).
TD : Discussion et questionnaires pour réviser et consolider les connaissances acquis en CM.
TP : Expériences en laboratoire pour illustrer et consolider les principes de fonctionnement des divers systèmes sensorielles, en particulier sur l’Homme et des modèles animaux choisis.
EP5.3.2 Anatomie et Physiologie animale
Élément Constitutif 38 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs
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Connaitre les structures anatomiques et les grandes fonctions chez les animaux, a fin de comprendre la relation entre structure et fonction. Étudier l’anatomie et la physiologie de manière comparée.
Contenu:
Cours : Présentation des structures associées à des fonctions principales : circulation, respiration, digestion, locomotion, soutien. Les structures anatomiques et les fonctionnalités seront étudiées de manière comparée et évolutive.
TD : Une des séances TD se tiendra au Muséum d’Histoire Naturelle de Tours où les aspects professionnels du travail au Muséum seront présentés : fonctionnement administrative, aspects juridiques, conservation du matériel, pédagogie. Les autres TD seront consacrés à la discussion sur les aspects comparatives et fonctionnelle de l’organisation anatomique des animaux.
TP : Appliquer les connaissances dans les travaux pratiques. Observation des spécimens conservés et vivants, afin de comparer leur anatomie et comprendre celle-ci en termes de phylogénie et le mode de vie des différents groupes d’animaux.
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- EP5.4.1 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM (Cours Magistral)3 h
- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD (Travaux Dirigés)4 h
- EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP (Travaux Pratiques)5 h
EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie CM
Cours Magistral 3 h
En savoir plusEP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TD
Travaux Dirigés 4 h
En savoir plusEP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie TP
Travaux Pratiques 5 h
En savoir plus -
- EP5.4.3 Outils moléculaires CM (Cours Magistral)6 h
- EP5.4.3 Outils moléculaires TD (Travaux Dirigés)14 h
EP5.4.3 Outils moléculaires CM
Cours Magistral 6 h
En savoir plusEP5.4.3 Outils moléculaires TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plus -
- EP5.4.4 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.4.4 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP5.4.4 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.4.4 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
En savoir plus
EP5.4.1 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP5.4.2 Statistiques appliquées à la biologie
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : A partir de données récoltées, par exemple lors de stages, d’expériences en TP ou de sortie de terrain, les étudiants devront savoir quel test statistique appliquer en fonction du type de données obtenues (quantitatives, qualitatives, …) et comment l’utiliser pour pouvoir valider ou non leurs hypothèses et répondre à une question posée.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Test du ?2 - Tests non paramétriques de comparaison de 2 échantillons indépendants : Test des médianes, Mann-Whitney, Kolmogorov-Smirnov.
TD : Applications de ces tests non paramétriques à des jeux de données.
TP : Utilisation du logiciel R pour ces tests non paramétriques.
EP5.4.3 Outils moléculaires
Élément Constitutif 20 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Cet EP a pour objectif que les étudiants acquièrent les bases de biologie cellulaire et moléculaire en continuité des modules de L2SV et les techniques de biologie moléculaire nécessaires à l’étude des écosystèmes.
Contenu
Cours : Notions nécessaires à la compréhension des mécanismes de la régulation transcriptionnelle (3h) – Outils de biologie moléculaire : PCR, RT-PCR, Western-blot, ELISA, NGS (RNAseq-Métagénomique-DNA environnemental) (3h)
TD : Exercices d’applications des notions vues en cours et analyse de résultats expérimentaux issus de publications scientifiques. Présentation de résultats expérimentaux et communication scientifique.
EP5.4.4 Mobil
4 h
En savoir plus
Module 5.1 : Génétique des populations/Ecologie ou réponse
UE 72 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.2 : Relations plantes- organismes et projet
UE 68 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.3 : Anatomie-Physiologie animale et Ecologie
UE 68 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.4 : Compétences transversales
UE 54 h - 6 Crédits ECTS
En savoir plus -
Semestre 5
Semestre 5
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Semestre 5
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- 5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire CM (Cours Magistral)18 h
- 5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire TD (Travaux Dirigés)12 h
5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire CM
Cours Magistral 18 h
En savoir plus5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plus -
- 5.1.2 Immunologie CM (Cours Magistral)12 h
- 5.1.2 Immunologie TD (Travaux Dirigés)6 h
- 5.1.2 Immunologie TP (Travaux Pratiques)4 h
5.1.2 Immunologie CM
Cours Magistral 12 h
En savoir plus5.1.2 Immunologie TD
Travaux Dirigés 6 h
En savoir plus5.1.2 Immunologie TP
Travaux Pratiques 4 h
En savoir plus -
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie CM (Cours Magistral)3 h
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TD (Travaux Dirigés)4 h
- 5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TP (Travaux Pratiques)5 h
5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie CM
Cours Magistral 3 h
En savoir plus5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TD
Travaux Dirigés 4 h
En savoir plus5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie TP
Travaux Pratiques 5 h
En savoir plus
5.1.1 Biologie cellulaire et moléculaire
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs : Cette EP permettra aux étudiants d’acquérir des notions disciplinaires approfondies de Biologie cellulaire et moléculaire ainsi que les méthodes d’analyse de résultats expérimentaux.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Organisation des génomes et structures des chromosomes eucaryotes. Voies de transduction de signal. Régulation épigénétique, transcriptionnelle, post-transcriptionnelle, traductionnelle de l’expression des gènes. Régulation du cycle cellulaire
TD : Analyse de résultats expérimentaux issus d’articles scientifiques en anglais illustrant les notions scientifiques vues en cours
5.1.2 Immunologie
Élément Constitutif 22 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : Découvrir les bases fondamentales de l’immunologie, ses concepts moléculaires ainsi que ses acteurs humoraux et cellulaires. Il s’agit de comprendre la dynamique des réponses immunitaires innées et adaptatives ainsi que certaines fonctions effectrices permettant l’élimination de l’agent pathogène. Des notions d’immunothérapies seront également abordées. Les TD et TP permettront aux étudiants d’appréhender les méthodologies d’exploration des réponses immunitaires développées à des fins de recherche fondamentale et pour le diagnostic clinique.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Les organes du système immunitaire, Les acteurs moléculaires et cellulaires impliqués lors des réponses immunitaires innées et adaptatives
TD : Description des techniques utilisées en immunologie clinique et en recherche fondamentale - Exercices d’application
TP : Observation de cellules immunitaires et mise en évidence d’une réaction antigènes/anticorps
5.1.3 Statistiques appliquées à la biologie
Élément Constitutif 12 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs : A partir de données récoltées, par exemple lors de stages, d’expériences en TP ou de sortie de terrain, les étudiants devront savoir quel test statistique appliquer en fonction du type de données obtenues (quantitatives, qualitatives, …) et comment l’utiliser pour pouvoir valider ou non leurs hypothèses et répondre à une question posée.
En savoir plus
Contenu:
Cours : Test du ?2 - Tests non paramétriques de comparaison de 2 échantillons indépendants : Test des médianes, Mann-Whitney, Kolmogorov-Smirnov.
TD : Applications de ces tests non paramétriques à des jeux de données.
TP : Utilisation du logiciel R pour ces tests non paramétriques.
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- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule CM (Cours Magistral)26 h
- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TD (Travaux Dirigés)28 h
- EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule CM
Cours Magistral 26 h
En savoir plusEP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TD
Travaux Dirigés 28 h
En savoir plusEP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule TP
Travaux Pratiques 8 h
En savoir plus -
- EP5.2b Virologie CM (Cours Magistral)30 h
- EP5.2b Virologie TD (Travaux Dirigés)18 h
- EP5.2b Virologie TP (Travaux Pratiques)14 h
EP5.2b Virologie CM
Cours Magistral 30 h
En savoir plusEP5.2b Virologie TD
Travaux Dirigés 18 h
En savoir plusEP5.2b Virologie TP
Travaux Pratiques 14 h
En savoir plus -
- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires CM (Cours Magistral)30 h
- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TP (Travaux Pratiques)20 h
EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires CM
Cours Magistral 30 h
En savoir plusEP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires TP
Travaux Pratiques 20 h
En savoir plus
EP5.2a Stratégies moléculaires d'étude de la cellule
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs :
En savoir plus
Cette UE a pour objectif de donner aux étudiants les outils nécessaires pour l’analyse moléculaire de processus biologiques par l’élaboration de plans expérimentaux pouvant conduire à la rédaction d’un projet. Cette démarche intégrée est applicable aussi bien à l’étude d’une population, qu’au fonctionnement d’un tissu, d’une cellule procaryote ou d’une cellule eucaryote.
Contenu :
Cours : Technologies d’analyse de l’ADN (hybridation, PCR, séquençage, bio-informatique). Stratégies d’analyse moléculaire utilisant l’ADN (marqueurs moléculaires, clonage, base de données, empreintes génétiques, marqueurs épigénétiques, séquençage haut-débit) et de la modification des génomes (RNAi, CRISPR-Cas9). Protocoles expérimentaux pour l’étude de la production et la détection d’ARN -Le monde des petits ARN application aux cancers - Protocoles expérimentaux pour l’étude de la production et la détection des protéines - Étude des interactions acides nucléiques/protéines - Biotechnologie, Thérapie cellulaire et génique- Conceptualisation, mise en place d’un projet expérimental.
TD : Analyse de résultats expérimentaux et analyse d’articles en anglais illustrant les notions développées en cours. Mise en place de projets expérimentaux pour répondre à des questions scientifiques et réflexions sur les résultats attendus. Production d’un poster et d’un résumé type colloque sur une thématique scientifique et exposition dans les locaux de la faculté des sciences.
TP : Recherche d’informations sur un gène dans les bases de données web et construction d’un plan expérimental informatique pour l’expression d’un gène en cellules eucaryotes.
EP5.2b Virologie
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
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Maîtriser la diversité des cycles de multiplication des virus et intégrer le déroulement d’une infection virale et ses mécanismes de régulation. Savoir analyser, mobiliser ses connaissances, communiquer et s’ouvrir à un travail collaboratif notamment à travers la présentation d’articles donnés en langue anglaise en groupe.
Contenu:
Cours : Cycle de réplication virale et particularité des grandes familles virales – Diversité, organisation et évolution des génomes viraux
TD : Applications du cours sous forme de présentation d'articles et d’exercices..
TP : Expression d’une protéine recombinante dans un système baculovirus-cellules d’insectes.
Pré-requis : avoir suivi un enseignement de microbiologie générale et si possible de génétique et/ou de biologie moléculaire et cellulaire.
EP5.2c Physiopathologie des voies circulatoires
Élément Constitutif 62 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
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Comprendre et se familiariser avec les grands principes de la physiologie impliquant les voies circulatoires et les vaisseaux sanguins en particulier. Seront enseignés les mécanismes de régulation dans des contextes physiologique et pathologique. Les exemples porteront sur les mammifères et notamment l'Homme.
Contenu:
Cours :
Physiologie vasculaire : Caractéristique de la cellule musculaire lisse vasculaire, couplage excitation-contraction et contrôle de l’appareil contractile.
Pathologies vasculaires : Rôle des vaisseaux sanguins dans des conditions pathologiques (resténose, hypertension, cancer…)
TP : Activité contractile du muscle lisse vasculaire et simulation informatique des voies d’entrées du calcium.
TD : A partir d’exemples, les enseignements rassemblent des exercices d’application des cours, des études de cas pathologiques et une préparation aux TP.
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- EP5.3a Bactériologie CM (Cours Magistral)38 h
- EP5.3a Bactériologie TD (Travaux Dirigés)18 h
- EP5.3a Bactériologie TP (Travaux Pratiques)10 h
EP5.3a Bactériologie CM
Cours Magistral 38 h
En savoir plusEP5.3a Bactériologie TD
Travaux Dirigés 18 h
En savoir plusEP5.3a Bactériologie TP
Travaux Pratiques 10 h
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- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 CM (Cours Magistral)16 h
- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TD (Travaux Dirigés)12 h
- EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TP (Travaux Pratiques)8 h
EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 CM
Cours Magistral 16 h
En savoir plusEP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TD
Travaux Dirigés 12 h
En savoir plusEP5.3b.1 Physiologie des régulations 2 TP
Travaux Pratiques 8 h
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- EP5.3b.2 Neuro-anatomie CM (Cours Magistral)20 h
- EP5.3b.2 Neuro-anatomie TD (Travaux Dirigés)10 h
EP5.3b.2 Neuro-anatomie CM
Cours Magistral 20 h
En savoir plusEP5.3b.2 Neuro-anatomie TD
Travaux Dirigés 10 h
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EP5.3b.1 Physiologie des régulations 2
Élément Constitutif 36 h - 4 Crédits ECTS
Contenu:
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Cours : Physiologie rénale – Physiologie cardiaque – Physiologie respiratoire – Régulation de la pression artérielle – Régulation hydrique et acido-basique. Régulation électrolytique
TD : Exercices sur les méthodes d'étude en physiologie et les différentes régulations (hydrique, acido-basique) – Étude de cas pathologiques
TP : Mesure des paramètres physiologiques humains : mesure du pouls et de la pression artérielle – spirométrie – Réalisation d’un ECG- Mesure des différents paramètres lors d’un exercice physique.
EP5.3b.2 Neuro-anatomie
Élément Constitutif 30 h - 4 Crédits ECTS
Contenu:
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Cours : Bases neuro-anatomiques, fonctionnelles et cliniques du système nerveux central. Enseignement séquencé en six chapitres : 1. Généralités ; 2. Moelle spinale ; 3. Tronc cérébral ; 4. Cervelet ; 5. Cerveau ; 6. Synthèses. A travers ces chapitres, les bases neurobiologiques de la perception somato-sensorielle et de la motricité somatique seront abordées.
TD : 1. Évolution du SNC, 2. Développement du SNC, 3. Motricité somatique, 4. Système neurovégétatif, 5. Exercice de neuro-anatomie clinique - révisions
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- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions CM (Cours Magistral)38 h
- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TD (Travaux Dirigés)19 h
- EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TP (Travaux Pratiques)9 h
EP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions CM
Cours Magistral 38 h
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TD
Travaux Dirigés 19 h
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions TP
Travaux Pratiques 9 h
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EP5.3a Bactériologie
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
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Approfondir les connaissances sur la physiologie et le mode de vie des bactéries et sur la régulation de l’expression de leur génome, acquérir les concepts et approches techniques biochimiques et moléculaires pour l’identification des bactéries, intégrer le rôle des bactéries dans l’infectiologie, comprendre les relations entre les bactéries et leurs environnements. Trouver l’information pertinente, exploiter ses connaissances et développer son analyse notamment à travers l’étude de cas cliniques
Contenu:
Cours :
Bactériologie : Identification phénotypique et génotypique des bactéries - Bactéries et santé (Quorum sensing, biofilm, pathogénicité, facteur de virulence, antibactériens) - Génie microbiologique - Cytosquelette et Histone-like - Organisation du génome des procaryotes ; particularités - Plasmides, éléments génétiques mobiles - Variations, mutations – microbiotes et leur importance.
Parasitologie : diversité des parasites et exemples de cycles parasitaires
TD : Applications du cours sous forme d'exercices - Etude de cas clinique - Présentation d'articles en langue française
TP : Synthèse de biofilm - CMI/CMB/Antibiogramme - Sélection de mutants.
Pré-requis : avoir suivi un enseignement de microbiologie générale.
EP5.3b Physiologie des régulations 2 et Neuro-anatomie
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusEP5.3c Biomolécules : Structure-Fonctions
Élément Constitutif 66 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs
En savoir plus
Cet enseignement a pour but d’apporter aux étudiants des connaissances solides dans le domaine de la biochimie générale. Seront développés les aspects structuraux des principales classes de biomolécules (protéines, sucres, lipides) en relation avec leur fonction biologique ainsi que des éléments d’enzymologie générale. Les compétences acquises dans ce module permettront aux étudiants d’avoir une meilleure compréhension des phénomènes biologiques au niveau moléculaire.
Contenu:
Cours :
Structure et fonction des protéines: acides aminés comme constituants des protéines, éléments de chimie des protéines, méthode d’étude des séquences, les différents niveaux d’organisation structurale, méthodes de détermination des structures 3D, relations structure-fonction, assemblages protéiques supramoléculaires : exemples des virus sphériques
- Sucres et glycoconjugués: Structure et fonctions des oses simples et des glycoconjugués (protéoglycanes et glycoprotéines). Métabolisme des glycoprotéines. Rôle des glycoconjugués et des lectines dans les mécanismes de reconnaissances cellulaires
- Lipides et membranes: Constituants membranaires et principes de l’organisation membranaire, Transports membranaires
- Enzymologie générale: Nomenclature et classification, spécificité d'action des enzymes, cinétique des réactions à un substrat, mesure des activités enzymatiques, cinétique des réactions enzymatiques en présence d’inhibiteurs.
TD : Exercices d’application portant sur : spectrophotométrie, structure des protéines, équilibres acido-basiques et solutions tampons, cinétique enzymatique
TP : Étude fonctionnelle d’une protéase à sérine
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- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire CM (Cours Magistral)1 h
- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TD (Travaux Dirigés)10 h
- EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TP (Travaux Pratiques)29 h
EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire CM
Cours Magistral 1 h
En savoir plusEP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TD
Travaux Dirigés 10 h
En savoir plusEP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire TP
Travaux Pratiques 29 h
En savoir plus - EP5.4.2 Anglais (Élément Constitutif)18 h - 2 Crédits ECTS
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- EP5.4.3 Mobil CM (Cours Magistral)2 h
- EP5.4.3 Mobil TD (Travaux Dirigés)2 h
EP5.4.3 Mobil CM
Cours Magistral 2 h
En savoir plusEP5.4.3 Mobil TD
Travaux Dirigés 2 h
En savoir plus
EP5.4.1 Projet expérimental transdisciplinaire
Élément Constitutif 40 h - 4 Crédits ECTS
Objectifs Cette EP a pour but de sensibiliser les étudiants aux moyens de traiter une question biologique par l’élaboration de stratégies d’analyses, la mise en œuvre de méthodologies expérimentales complémentaires faisant appel à plusieurs champs disciplinaires, la présentation et l’analyse de leurs résultats en adoptant une démarche scientifique, tout en considérant la biologie de manière intégrée, de l’organisme à la molécule.
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Contenu:
La problématique scientifique repose sur l’analyse d’une thématique sous différents aspects : physiologique, bactériologique, génétique, moléculaire et biochimique.
CM : Présentation générale du modèle d’étude et identification de problématiques scientifiques associées.
TD : Outils à mettre en œuvre pour répondre à une question scientifique. Données pratiques à prendre en compte (calculs de dilution, molarité, dilution sérielle…). Présentation de résultats à l’identique d’une publication : droite étalon, histogrammes, résultats de gel. Méthodes d’analyse de résultats dans une démarche scientifique.
TP : L’organisation de ce TP se fera sur la base de 18 étudiants par groupe, encadré par 1 enseignant. Le TP sera effectué sur une semaine en continu afin de mettre les étudiants en situation de mener et contrôler leur projet scientifique, de l’élaboration à l’analyse des résultats.
EP5.4.2 Anglais
Élément Constitutif 18 h - 2 Crédits ECTS
Objectifs :
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L’objectif pédagogique est de rendre l’étudiant toujours plus autonome dans sa maîtrise de l’anglais.
Il est donc donné à chaque étudiant les moyens de consolider et développer ses capacités dans les 5 compétences langagières telles qu’elles sont décrites dans le Cadre européen Commun de Référence des Langues (CECRL) : compréhension écrite, compréhension orale, expression écrite, expression orale en continu, expression orale en interaction.
Contenu :
TD : L’alternance séances de Travaux Dirigés / séances CRL favorise l’encadrement et l’individualisation des apprentissages.
Les enseignements sont également conçus de façon à fournir les outils nécessaires à la validation de certifications nationales (CLES 2) et internationales (TOEIC par exemple), à l’insertion professionnelle et à la mobilité internationale.
EP5.4.3 Mobil
4 h
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Module 5.1 : Biologie cellulaire, Immunologie, Statistiques
UE 64 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.2 : Compétences disciplinaires BS 1
UE 62 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.3 : Compétences disciplinaires BS 2
UE 66 h - 8 Crédits ECTS
En savoir plusModule 5.4 : Compétences transversales
UE 62 h - 6 Crédits ECTS
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Semestre 6
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- EP6.1a Physiologie de la nutrition CM (Cours Magistral)34 h
- EP6.1a Physiologie de la nutrition TD (Travaux Dirigés)14 h
- EP6.1a Physiologie de la nutrition TP (Travaux Pratiques)20 h
EP6.1a Physiologie de la nutrition CM
Cours Magistral 34 h
En savoir plusEP6.1a Physiologie de la nutrition TD
Travaux Dirigés 14 h
En savoir plusEP6.1a Physiologie de la nutrition TP
Travaux Pratiques 20 h
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EP6.1a Physiologie de la nutrition
Élément Constitutif 68 h - 8 Crédits ECTS
Objectifs L’objectif de cette UE est d’acquérir et comprendre les grands principes de physiologie de la nutrition et les mécanismes de régulation associés en particulier endocrinien dans un contexte physiologique et pathologique
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Contenu:
Cours : ils abordent les notions mécanistiques et anatomiques de système digestif, la signalisation cellulaire et métabolismes, le contrôle hormonal de la prise alimentaire, la diabétologie, l’obésité, les modifications métaboliques et la nutrition dans un contexte cancéreux et enfin Alimentation et mode de vie.
TD : ils rassemblent des exercices d’application des CM, la préparation de TPs et une partie associant sensoriel et nutrition sera abordée. Nous aborderons également les notions de besoin nutritionnels et apports nutritionnels.
TP : ils présentent l’étude de la motilité intestinale de cobayes couplée à l’étude du métabolisme hépatique (protéique, triglycérides, glucose libre et glucose issus du glycogène) chez des cobayes ayant eu accès à l’alimentation standard et ayant eu le choix dans leur cage entre deux boissons, de l’eau et une eau sucrée ou de l’eau et une eau édulcorée selon les groupes d’animaux. De plus dans le cadre des TPs, les étudiants remplissent un questionnaire alimentaire associée à des mesures par impédancemétrie permettant l’évaluation de la masse musculaire, grasse et hydrique intégrant ainsi les notions de besoin nutritionnels et apports nutritionnels conseillés vus en cours.
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