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lucas.sire@univ-tours.fr

Discipline(s)

Génétique moléculaire, génomique et protéomique, Biologie des populations et écologie

Discipline(s) enseignée(s)

Eco-éthologie (L2)
Physiologie de l'insecte (M1)

Thèmes de recherche

Thèse de doctorat :

Impact du management forestier et du dépérissement lié aux changements globaux sur les communautés d'arthropodes par approche méta-code-barres ADN.
Supervision :Dr. Carlos LOPEZ-VAAMONDE & Dr. Elisabeth HERNIOU

Résumé :

Les forêts souffrent d'une augmentation en fréquence et en sévérité des sécheresses estivales et des infestations de pathogènes et d'insectes. Ces facteurs sont la cause d'une mortalité accrue et d'envergure d'espèces d'arbres clefs. Néanmoins, comment ce dépérissement forestier et les changements en composition forestière associés, ainsi que les plans de coupes sanitaires et de retrait du bois mort affectent la diversité locale reste inconnu. Le but de cette thèse est donc de quantifier l'impact sur la biodiversité du dépérissement et du management forestier en mesurant les changements taxinomiques des communautés d'invertébrés le long d'un gradient de dépérissement et de coupes sanitaires sur Sapin pectiné (Abies alba) dans les Pyrénées françaises.

Activités / CV

Publications :

Lopez-Vaamonde C., Sire L., Rasmussen B., Rougerie R., Wieser C. Ahamadi A., Minet J., deWaard J., Decaëns T., Lees D. DNA barcodes reveal deeply neglected diversity and numerous invasions of micromoths in Madagascar. Genome, 2018

Communications :

Oral DNA Metabarcoding to quantify the ecological impact of climate induced forest diebacks in the Pyrenees- 8th International Barcode of Life Conference  - Trondheim, Norvège (17 - 20 Juin 2019)
* prix ID-Gene ecodiagnostics

Oral DNA Metabarcoding to quantify the response of insect diversity to mountain forest die-offs in the French Pyrenees- European Ph.D. Network "Insect Science" IX Annual Meeting - Florence, Italie (14 - 16 Nov. 2018)

Oral DNA Metabarcoding to quantify the response of insect diversity to mountain forest die-offs in the French Pyrenees- International Conference on Ecological Sciences SFEcologie 2018 - Rennes, France (22 - 25 Oct. 2018)

Oral Impact écologique du dépérissement forestier et des coupes sanitaires sur les communautés d'insectes dans les Pyrénées françaises- 12èmesRencontres du Groupe des Entomologistes Forestiers Francophones - Houffalize, Belgique (13 - 15 Sept. 2018)

Oral Next-Generation Sequencing of Natural History Museum collections to enhance the DNA barcode database of European saproxylic beetles- 10thSymposium on the Conservation of Saproxylic Beetles - Saint-Oswald, Allemagne (8 - 10 Juin 2018)

PosterQuantifying the impact of tree-diebacks and salvage logging on mountain forest biodiversity using metabarcoding - 4ème Congrès GDR de génomique environnementale - Marseille, France (13 - 15 Sept. 2017)